| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,979,205 | G→A | N974N (AAC→AAT) | unknown ← | RTX toxins determinant A and related Ca2+‑binding proteins |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,979,205 | 0 | G | A | 100.0% | 213.6 / NA | 74 | N974N (AAC→AAT) | unknown | RTX toxins determinant A and related Ca2+‑binding proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/33); total (41/33) | |||||||||||
GTAGTTGCTAACGAATTTGCGTAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATAATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGTCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTGTTCCCACTCTTATCAAAAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATCTAATCCTGCCGATGAATTAGGTTTACTAAACCATCCTTTAAATGTTACTG > 1/1978966‑1979443 | gtagtTGCTAACGAATTTGCGTAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCActttt > 1:571617/1‑248 (MQ=255) 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ccTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTg < 1:203460/138‑1 (MQ=255) ccTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGa > 1:647766/1‑251 (MQ=255) ttCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAAtt > 1:285819/1‑251 (MQ=255) cccGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTatta < 1:101569/249‑4 (MQ=255) cGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAAc < 1:513418/251‑1 (MQ=255) cGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAAc < 1:155929/251‑1 (MQ=255) gCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAAcc < 1:755845/250‑1 (MQ=255) gCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATc > 1:513062/1‑249 (MQ=255) ctctTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTc < 1:148107/177‑1 (MQ=255) ctctTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCtt > 1:715767/1‑251 (MQ=255) tGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTaaa < 1:358899/251‑1 (MQ=255) gTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTAAATg < 1:782172/249‑1 (MQ=255) gTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTAAATGTTActg > 1:253655/1‑247 (MQ=255) cTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGt > 1:151538/1‑142 (MQ=255) ttttATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGt > 1:214301/1‑215 (MQ=255) | GTAGTTGCTAACGAATTTGCGTAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATAATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGTCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTGTTCCCACTCTTATCAAAAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATCTAATCCTGCCGATGAATTAGGTTTACTAAACCATCCTTTAAATGTTACTG > 1/1978966‑1979443 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |