| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 298,109 | C→T | A88T (GCG→ACG) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 298,109 | 0 | C | T | 100.0% | 240.3 / NA | 83 | A88T (GCG→ACG) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (28/55); total (28/55) | |||||||||||
CCTTGTATTTGTAATAACCAATTTCTTAATTGTTTACCATTACCAAATGGTGGGTTGGTTTCTTTCAGAAATTTTAGAGCTTCAGCGAGATAATATGATTTTTGTTTTGCAAAACGATATTTAACTTTTTTTCCATTAATTTGTAATGGTTTAGACAGCAAGTTAAAAATAACTTCTTTATCTGTTGGCATATCAGAAAATACATTCTGAGATTTGAGGTAGTGAAACGCAGCCAAACCAACATATGCAGGTATACCATACCCACCTAAAAGACAAGCGCATACTTCTTCAATAAATGATTCTCCCAGCCGGTATTTGGGAGTGTTATTTAATTCTCGGTTAGATAATACTCGGTAATACCAATAGGCTGGAGAAGGAAATTGTTCAATTTTCCCCCAAACTACACCTGGAAGAACCTCATTCTCTGGGGCGGGGAGGGATAATAACTGCATACAAGAAC > 1/297880‑298339 | ccTTGTATTTGTAATAACCAATTTCTTAATTGTTTACCATTACCAAATGGTGGGTTGGTTTCTTTCAGAAATTTTAGAGCTTCAGCGAGATAATATGATTTTTGTTTTGCAAAACGATATTTAACTTTTTTTCCATTAATTTGTAATGGTTTAGACAGCAAGTTAAAAATAACTTCTTTATCTGTTGGCATATCAGAAAATACATTCTGAGATTTGAGGTAGTGAAACGTAGCCAAACCAACATATGCAgg < 1:572540/251‑1 (MQ=255) 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CCTTGTATTTGTAATAACCAATTTCTTAATTGTTTACCATTACCAAATGGTGGGTTGGTTTCTTTCAGAAATTTTAGAGCTTCAGCGAGATAATATGATTTTTGTTTTGCAAAACGATATTTAACTTTTTTTCCATTAATTTGTAATGGTTTAGACAGCAAGTTAAAAATAACTTCTTTATCTGTTGGCATATCAGAAAATACATTCTGAGATTTGAGGTAGTGAAACGCAGCCAAACCAACATATGCAGGTATACCATACCCACCTAAAAGACAAGCGCATACTTCTTCAATAAATGATTCTCCCAGCCGGTATTTGGGAGTGTTATTTAATTCTCGGTTAGATAATACTCGGTAATACCAATAGGCTGGAGAAGGAAATTGTTCAATTTTCCCCCAAACTACACCTGGAAGAACCTCATTCTCTGGGGCGGGGAGGGATAATAACTGCATACAAGAAC > 1/297880‑298339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |