| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,978,348 | T→C | K181K (AAA→AAG) | unknown ← | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,978,348 | 0 | T | C | 100.0% | 186.8 / NA | 62 | K181K (AAA→AAG) | unknown | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (38/24); total (38/24) | |||||||||||
TCCGAATTTGATCTAACTCACGAACACGAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAATGACGAAAAAGCCTTGCTCCCAATTCGACATCAATACGACTTGTACTATGAGCAAAAACATAGGTTCTCAAGCCTCCCAAGATTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATTACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAGGACTTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGTGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACGGCAGGAATAAACCAGGTAAAGTCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGATGCAATTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCATTTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGAATTAG > 1/1978104‑1978590 | tCCGAATTTGATCTAATTCACGAACACGAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAGTAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATcc < 1:596756/251‑1 (MQ=255) ccGAATTTGATCTAATTCACGAACACGAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCa < 1:250833/251‑1 (MQ=255) gATCTAATTCACGAACACGAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGACTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGa > 1:619256/1‑249 (MQ=255) aTCTAATTCACGAACACGAGCCATCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCTAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACtt > 1:709014/1‑251 (MQ=255) cGAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGgtgt < 1:836711/251‑1 (MQ=255) gAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATcc < 1:84237/224‑1 (MQ=255) gAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAag > 1:205949/1‑242 (MQ=255) ccACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAAt > 1:56748/1‑250 (MQ=255) ccACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATc < 1:67996/251‑1 (MQ=255) ccACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATc < 1:555804/251‑1 (MQ=255) ccACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATc < 1:490094/251‑1 (MQ=255) ccGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGt > 1:609030/1‑251 (MQ=255) aTCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATc < 1:373170/244‑1 (MQ=255) cccAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCaaaaa < 1:391527/251‑1 (MQ=255) aaCCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATc < 1:375627/238‑1 (MQ=255) gCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATc < 1:529010/173‑1 (MQ=255) gCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGaaa < 1:301673/232‑1 (MQ=255) gCTAATAAGTGACGAAAAAGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATaaa > 1:440328/1‑251 (MQ=255) aaaaaGTCTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTAtt > 1:180737/1‑251 (MQ=255) gtcTTGCTCCCAGTTCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATcc < 1:521551/153‑1 (MQ=255) cagttCGACATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAg < 1:115039/197‑1 (MQ=255) cATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATc > 1:356743/1‑167 (MQ=255) cATCAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGt > 1:491926/1‑205 (MQ=255) cAATACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACGACAATAGCAAGAGTCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTa < 1:455203/251‑1 (MQ=255) aaTACGACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATc > 1:108699/1‑163 (MQ=255) gACTTGTGCTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCAc < 1:470233/133‑1 (MQ=255) gtgcTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATc > 1:849596/4‑153 (MQ=255) tgcTATGAGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAAttt < 1:378813/248‑1 (MQ=255) aGCAAACACATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAAcc < 1:179879/227‑1 (MQ=255) acaCATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTc > 1:95941/3‑249 (MQ=255) caCATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATc > 1:885244/2‑108 (MQ=255) caCATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTa > 1:83531/2‑251 (MQ=255) cATAGGTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAAttt > 1:703163/1‑235 (MQ=255) ggTTCTCAGCCCCCCCAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGAGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAg > 1:401112/1‑251 (MQ=255) gttctcagcccccccAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGaaa < 1:758222/148‑1 (MQ=255) gttctcagcccccccAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAAt > 1:300907/13‑248 (MQ=255) gttctcagcccccccAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGa > 1:527488/13‑251 (MQ=255) ccccAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCGATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGacg > 1:62356/2‑249 (MQ=255) ccccAAGACTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGacg > 1:63219/2‑249 (MQ=255) aGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCtt > 1:132698/1‑251 (MQ=255) gACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCttt > 1:227416/1‑251 (MQ=255) gACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCttt > 1:560011/1‑251 (MQ=255) gACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGCGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTAc > 1:764145/1‑213 (MQ=255) cTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGaaa > 1:284510/1‑126 (MQ=255) cTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATc > 1:829824/1‑239 (MQ=255) cTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGa > 1:349983/1‑251 (MQ=255) tAGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAAt > 1:876964/1‑208 (MQ=255) aGCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAAt > 1:198157/1‑102 (MQ=255) gCAAGAGCCACTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGtt > 1:98813/1‑250 (MQ=255) cACTGTAATCACGTTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTactc < 1:785753/82‑4 (MQ=255) cTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATcc > 1:96277/1‑50 (MQ=255) cTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAAcc < 1:483790/162‑1 (MQ=255) cTGTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCa > 1:702999/1‑251 (MQ=255) aggTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCa > 1:47721/3‑251 (MQ=255) gTAATCACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATc < 1:484897/78‑1 (MQ=255) aaTGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCATTTTTGTCTAAAAc < 1:724083/251‑1 (MQ=255) aTGTTGAAAATCCACGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGc > 1:811098/1‑120 (MQ=255) cGGTGAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCATTTTTGTCTAAAAc > 1:598554/1‑236 (MQ=255) gAACCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCATTTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGCAtt > 1:333185/1‑251 (MQ=255) aaCCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATg < 1:141377/167‑1 (MQ=255) aaCCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGt > 1:683780/1‑205 (MQ=255) aCCAAGACCTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGCGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCATTTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGCATTAg > 1:683547/1‑251 (MQ=255) | TCCGAATTTGATCTAACTCACGAACACGAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAAAGCTAATAAATGACGAAAAAGCCTTGCTCCCAATTCGACATCAATACGACTTGTACTATGAGCAAAAACATAGGTTCTCAAGCCTCCCAAGATTATTTCAAATAAGACTACAATAGCAAGAGCCACTGTAATTACATTCAATGTTGAAAATCCACGGTGAACCAGGACTTTATCCATCACGACTTGAAAAAAGAGTGGTGTAATCAGTGCAAAAATTTGCAAAAATATAGAAACGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACGGCAGGAATAAACCAGGTAAAGTCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGATGCAATTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCATTTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGAATTAG > 1/1978104‑1978590 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |