| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,977,562 | A→G | R443R (CGT→CGC) | unknown ← | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,977,562 | 0 | A | G | 100.0% | 194.6 / NA | 67 | R443R (CGT→CGC) | unknown | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (37/30); total (37/30) | |||||||||||
CTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATGAGTTTAGTAAGCGTACTTTTCCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATATTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGGATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCCAAACGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACAGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGGTTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATCAATTGGATACCTTGCTGTCCGATCGTTGCAAGTACAGTCACTTTAAAACTCACAGCAACAT > 1/1977322‑1977803 | cTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATAAGTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAg < 1:624685/251‑1 (MQ=255) tGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATAAGTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGa < 1:519618/251‑1 (MQ=255) cGGAATATAAAAACGTTGGATAAGTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATAc < 1:150814/251‑1 (MQ=255) cGTTGGATAAGTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGaa > 1:618147/1‑251 (MQ=255) gTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAg > 1:485925/1‑251 (MQ=255) caacaaTACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGt > 1:324998/1‑251 (MQ=255) aTACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTTTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCg > 1:382408/1‑250 (MQ=255) aCCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCaa > 1:48820/1‑251 (MQ=255) aCCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCaa > 1:129395/1‑251 (MQ=255) cTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATAc > 1:678962/1‑177 (MQ=255) tcCCTGACTGATATCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCCGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATg > 1:229599/1‑251 (MQ=255) atatCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTaataat > 1:470451/1‑218 (MQ=255) atCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATAc > 1:20300/1‑161 (MQ=255) atCTAAGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATAc < 1:399275/161‑1 (MQ=255) aaGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATg < 1:10419/235‑1 (MQ=255) aaGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGc > 1:855018/1‑243 (MQ=255) aaGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAAt > 1:597701/1‑251 (MQ=255) aaGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAAt > 1:119857/1‑251 (MQ=255) aGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTa < 1:488548/230‑1 (MQ=255) aGTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATg < 1:802467/234‑1 (MQ=255) gTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAAt > 1:858064/1‑170 (MQ=255) gTTAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATa > 1:896051/1‑250 (MQ=255) ttAATACTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATAc < 1:145476/250‑1 (MQ=255) atactGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTaa > 1:160560/5‑251 (MQ=255) aTCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAAt > 1:185812/1‑251 (MQ=255) aTAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAAc < 1:762913/251‑1 (MQ=255) aaTCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAAtg < 1:293413/250‑1 (MQ=255) ggTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCtaataa < 1:705176/178‑1 (MQ=255) gTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTa > 1:291982/1‑197 (MQ=255) gCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAAtg < 1:379524/237‑1 (MQ=255) gCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATa > 1:502406/1‑251 (MQ=255) aaCTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAgat < 1:459554/250‑3 (MQ=255) aaCTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAgat < 1:506941/250‑3 (MQ=255) aCTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCgg > 1:9501/1‑219 (MQ=255) aCTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAgat < 1:500324/249‑3 (MQ=255) aCTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTg < 1:423497/251‑1 (MQ=255) aCTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCAAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTTGGCTAAACGAAACACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCgg > 1:517549/1‑219 (MQ=255) tAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAgat > 1:343586/1‑244 (MQ=255) tcACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGAt < 1:802112/251‑1 (MQ=255) cACCCTGAATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATc < 1:233517/103‑1 (MQ=255) ttCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATAc < 1:380504/251‑1 (MQ=255) tAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCAt < 1:127113/219‑1 (MQ=255) aTACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAAt < 1:482355/178‑1 (MQ=255) aTACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAAc > 1:580789/1‑181 (MQ=255) gTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCtaataa < 1:17802/109‑1 (MQ=255) gTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAAt > 1:437328/1‑167 (MQ=255) gTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGaaac > 1:629990/1‑226 (MQ=255) gTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATAc < 1:664347/229‑1 (MQ=255) gTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATAc > 1:297322/1‑229 (MQ=255) gTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAg > 1:111704/1‑251 (MQ=255) gTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAg > 1:544168/1‑251 (MQ=255) attattCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAgca < 1:801320/251‑3 (MQ=255) attCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATc < 1:369407/66‑1 (MQ=255) attCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGAtaagttg > 1:838608/1‑213 (MQ=255) ctctGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCa > 1:150534/1‑251 (MQ=255) tctGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCAc < 1:741488/251‑1 (MQ=255) ctGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCtt > 1:287259/1‑201 (MQ=255) ctGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATAcc > 1:96953/1‑220 (MQ=255) ctGTAGGCGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCa > 1:375073/1‑249 (MQ=255) cGAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCACTTTAAAAc < 1:475574/251‑1 (MQ=255) gAATTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCACTTTaaaa > 1:197262/1‑249 (MQ=255) aaTTAAGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGc < 1:678983/122‑1 (MQ=255) aaGCACATCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCACTTTAAAACTCGCAg > 1:405483/1‑251 (MQ=255) caTCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATc > 1:336947/1‑43 (MQ=255) caTCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCACTTTAAAACTCGCAGCAACa > 1:668156/1‑251 (MQ=255) aTCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCACTTTAAAACTCGCAGCAACAt < 1:7766/251‑1 (MQ=255) tCACCTAAGCGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACGGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAgat < 1:272945/163‑3 (MQ=255) | CTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATGAGTTTAGTAAGCGTACTTTTCCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTTAATATTGTTTAAAATCATAGGGGAATCCGGTTTATAGCGGAACTTAATATTTCTAAAACTAATCTCACCCTGGATTTCCGGTAATGATACTGAGGCGGTATTATTCTCTGTAGGCGAATTAAGCACATCACCCAAACGAGTAACAGAAATACCGACCTGTTGGAAATCTTGCCAGATCTGGGCTAAACGAATCACAGGGCTAATAATTTGTCCCGCAAGCATATTAAATGCAATTAGCTGACCAATACTTAAATCACCGGAAATAACTAAATGTGCGCCAAGCCATAGGTTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATCAATTGGATACCTTGCTGTCCGATCGTTGCAAGTACAGTCACTTTAAAACTCACAGCAACAT > 1/1977322‑1977803 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |