| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,977,180 | G→A | P571S (CCA→TCA) | unknown ← | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,977,180 | 0 | G | A | 100.0% | 188.7 / NA | 66 | P571S (CCA→TCA) | unknown | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (34/32); total (34/32) | |||||||||||
TTTTATGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCTTGGGTTATTGACTAGTGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGACGTTGTCCTCCGGACAAACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACCGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCTCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGGCATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAAGACGACACCGACTTGCCGGCGCAACCAGTTTGGATCGGCTAGCGCCAAATCGTGACCGTCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATGAGTTTAGTAAGCGTACTTTTCCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTT > 1/1976940‑1977426 | ttttGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCTTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGa > 1:799576/1‑251 (MQ=255) 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gCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATAAGTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTcc > 1:284966/1‑248 (MQ=255) aaTAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATAAGTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCctgac < 1:489981/251‑1 (MQ=255) aCCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATAAGTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATAc > 1:87954/1‑229 (MQ=255) tCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAAc < 1:532883/169‑1 (MQ=255) cATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATAAGTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCctgac < 1:776606/239‑1 (MQ=255) aTTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATAAGTTTAGTAAGCGTACTTTTTCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGtt < 1:785387/251‑1 (MQ=255) | TTTTATGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCTTGGGTTATTGACTAGTGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGACGTTGTCCTCCGGACAAACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACCGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCTCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGGCATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAAGACGACACCGACTTGCCGGCGCAACCAGTTTGGATCGGCTAGCGCCAAATCGTGACCGTCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAACGTTGGATGAGTTTAGTAAGCGTACTTTTCCCCGAACCTGAACGACCAACAATACCAATCACTTCTCCCTGACTGATATCTAAGTT > 1/1976940‑1977426 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |