| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,977,100 | C→A | T597T (ACG→ACT) | unknown ← | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,977,100 | 0 | C | A | 100.0% | 185.1 / NA | 65 | T597T (ACG→ACT) | unknown | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (33/32); total (33/32) | |||||||||||
ACCTTTGTCCATCACAATAATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACAGTACGATTTTGGCAAATTTTATGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCTTGGGTTATTGACTAGTGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGACGTTGTCCTCCGGACAAACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACCGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCTCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGGCATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAAGACGACACCGACTTGCCGGCGCAACCAGTTTGGATCGGCTAGCGCCAAATCGTGACCGTCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAA > 1/1976854‑1977340 | aCCTTTGTCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAgtgt < 1:590432/251‑1 (MQ=255) cTTTGTCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTta < 1:300699/251‑1 (MQ=255) tttGTCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTtat < 1:14757/251‑1 (MQ=255) tCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAAcc < 1:810527/251‑1 (MQ=255) tCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAAc < 1:189648/250‑1 (MQ=255) acaATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAAcc < 1:98481/245‑1 (MQ=255) atgatGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAAc > 1:43073/4‑241 (MQ=255) atgatGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTaa > 1:444671/4‑251 (MQ=255) tgatGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAAt < 1:179954/249‑1 (MQ=255) cGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAg < 1:727956/250‑1 (MQ=255) aTTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAAt > 1:34838/1‑238 (MQ=255) cAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTgcgcg > 1:122206/1‑250 (MQ=255) gTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAAcc > 1:247416/1‑218 (MQ=255) gCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAgtgt > 1:259418/1‑196 (MQ=255) aTGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCtt < 1:819584/207‑1 (MQ=255) gCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAAc > 1:30959/1‑250 (MQ=255) cggTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAAc > 1:253348/3‑189 (MQ=255) gTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCtttt > 1:306366/1‑250 (MQ=255) gTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCtttt > 1:751666/1‑250 (MQ=255) gTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCtttt > 1:802621/1‑250 (MQ=255) ttGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTgaca < 1:468003/251‑4 (MQ=255) ttttGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCTTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGa > 1:799576/1‑251 (MQ=255) tttgtgcatattatgcataATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGAt < 1:348178/247‑1 (MQ=255) gtgcatattatgcataATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTgcgcgcc < 1:839756/200‑4 (MQ=255) catattatgcataATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGtt < 1:661249/250‑1 (MQ=255) atattatgcataATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGAt > 1:569305/1‑244 (MQ=255) atattatgcataATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTaa > 1:172610/1‑251 (MQ=255) tattatgcataATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTaa > 1:813030/1‑250 (MQ=255) attatgcataATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATaa < 1:388843/160‑1 (MQ=255) atgcataATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAAcc > 1:440835/1‑159 (MQ=255) gcataATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAAcc > 1:14150/1‑157 (MQ=255) taATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATtc < 1:833537/251‑1 (MQ=255) ttttCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGAt < 1:705208/251‑1 (MQ=255) tttCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATa < 1:885928/251‑1 (MQ=255) tCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGAtt < 1:563836/251‑1 (MQ=255) gTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAAcc < 1:81868/193‑1 (MQ=255) gTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTctctct < 1:661709/237‑1 (MQ=255) cAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAAc < 1:330259/129‑1 (MQ=255) aGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAaca > 1:360603/1‑250 (MQ=255) gTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCgg > 1:72665/1‑205 (MQ=255) gCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTgcg > 1:465836/1‑154 (MQ=255) gCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACAtt > 1:677833/1‑251 (MQ=255) ggTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTg < 1:768141/202‑1 (MQ=255) ggTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCgg < 1:684436/169‑1 (MQ=255) ggTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGgcgtaa > 1:496902/1‑247 (MQ=255) aTTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATtc < 1:790001/184‑1 (MQ=255) gACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATtc < 1:11855/181‑1 (MQ=255) gACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGttt > 1:592006/1‑250 (MQ=255) cccTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCgg > 1:309460/1‑249 (MQ=255) cccTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCt < 1:267016/251‑1 (MQ=255) tGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTTCCCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAgt > 1:58778/1‑250 (MQ=255) cgcgATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAAt > 1:46291/1‑251 (MQ=255) cgATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCg < 1:310193/251‑1 (MQ=255) gTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAg > 1:679483/1‑251 (MQ=255) cctccGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGa > 1:548547/1‑250 (MQ=255) cctccGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGa > 1:480375/1‑250 (MQ=255) cctccGGACAGACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGAc < 1:234371/251‑1 (MQ=255) gaCCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGAc > 1:375659/2‑241 (MQ=255) tCCCTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGaa < 1:835748/251‑1 (MQ=255) cccTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACAcctac < 1:371860/176‑4 (MQ=255) cTGTT‑CCCCCACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAatat < 1:712496/251‑1 (MQ=255) cccccACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGgacg > 1:554592/1‑161 (MQ=255) cccccACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAGGACGACACCTACTTGCCGGCGTAACCAGTTTGGATCGGCTAGTGCCAAATCGTGACCATCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATaaaaa < 1:654123/251‑1 (MQ=255) ccccACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAatat > 1:746974/1‑116 (MQ=255) ccccACAACAGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCGCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGACATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCag > 1:56439/1‑155 (MQ=255) | ACCTTTGTCCATCACAATAATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACAGTACGATTTTGGCAAATTTTATGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCTTGGGTTATTGACTAGTGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGACGTTGTCCTCCGGACAAACCGGCTCCCTGTT‑CCCCCACAACCGTGTTATAACCTTCTCTTAATTCAGAAATAAAATCGTGCGCTCCCGCAAGTTTTGCCGCGGCAATAACCTTTTCCATTGGCATTCCCGGATTGGTTAACGCAATATTCTCTCTGATACTTCGATTAAGCAACACATTATCTTGCAAGACGACACCGACTTGCCGGCGCAACCAGTTTGGATCGGCTAGCGCCAAATCGTGACCGTCAATTAAGACTTGCCCCTGCTCCGGAATATAAAAA > 1/1976854‑1977340 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |