| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,976,872 | A→G | I673I (ATT→ATC) | unknown ← | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,976,872 | 0 | A | G | 100.0% | 226.7 / NA | 75 | I673I (ATT→ATC) | unknown | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (35/40); total (35/40) | |||||||||||
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ttCACCTTTGTCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTTCCCCCACAAcag < 1:484118/251‑3 (MQ=255) aCCTTTGTCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTTCCCCCACAACAgtgt < 1:590432/251‑1 (MQ=255) cTTTGTCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTTCCCCCACAACAGTGTta < 1:300699/251‑1 (MQ=255) tttGTCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTTCCCCCACAACAGTGTtat < 1:14757/251‑1 (MQ=255) tCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTTCCCCCACAACAGTGTTATAAcc < 1:810527/251‑1 (MQ=255) tCCATCACAATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTTCCCCCACAACAGTGTTATAAc < 1:189648/250‑1 (MQ=255) tCACAATGACGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTc > 1:67049/1‑106 (MQ=255) acaATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTTCCCCCACAAc < 1:285579/233‑1 (MQ=255) acaATGATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACGGTACGATCTTGGCAAATTTTGTGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCGTGGGTTATTGACTAATGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGGCGTTGTCCTCCGGACAGACCGGCTCCCTGTTCCCCCACAACAGTGTTATAAcc < 1:98481/245‑1 (MQ=255) | CAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAACCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCATACAATGCCAAAAGCCAAGTTTTCATTATCGTTCGTTCCTTTAATTTACTTGTAATTGGTGTAAATAAGAGTAAAGACCTTTTTCATCTTTCAGTAATTCCTGATGCTTGCCTTGTTCGATGATTTCACCTTTGTCCATCACAATAATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACAGTACGATTTTGGCAAATTTTATGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCTTGGGTTATTGACTAGTGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGACGTTGTCCTCCGGACAAACCGGCTCCCTGTTCCCCCACAACCGTGTTATAACC > 1/1976627‑1977111 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |