| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,976,827 | C→T | Q688Q (CAG→CAA) | unknown ← | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,976,827 | 0 | C | T | 100.0% | 183.9 / NA | 65 | Q688Q (CAG→CAA) | unknown | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (30/35); total (30/35) | |||||||||||
TGCATTTGATACAGGTGTTTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAACCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCATACAATGCCAAAAGCCAAGTTTTCATTATCGTTCGTTCCTTTAATTTACTTGTAATTGGTGTAAATAAGAGTAAAGACCTTTTTCATCTTTCAGTAATTCCTGATGCTTGCCTTGTTCGATGATTTCACCTTTGTCCATCACAATAATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACAGTACGATTTTGGCAAATTTTATGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCT‑‑TCATCAAAAATCAAAATCCTTGGGTTATTGACTAGTGCCCTTGCTATCGCGATCCGTTGACGTTGTCCTCCGGAC > 1/1976585‑1977073 | tgCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCATACAATGCCAAAAGCCAAGTTTTCATTATCGTTCGTCCCTTTAATTTACTTGTAATTGGTGTAAATAATAGTAAAGGCCTTTTTCATCTTTCAGTAATTCTTGATGCt < 1:187489/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |