| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,976,795 | G→T | S699Y (TCT→TAT) | unknown ← | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,976,795 | 0 | G | T | 100.0% | 171.1 / NA | 60 | S699Y (TCT→TAT) | unknown | RTX toxin transporter, ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (28/32); total (28/32) | |||||||||||
AGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTTTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAACCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCATACAATGCCAAAAGCCAAGTTTTCATTATCGTTCGTTCCTTTAATTTACTTGTAATTGGTGTAAATAAGAGTAAAGACCTTTTTCATCTTTCAGTAATTCCTGATGCTTGCCTTGTTCGATGATTTCACCTTTGTCCATCACAATAATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACAGTACGATTTTGGCAAATTTTATGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCTTGGGTTATTGACTAGTGCCC > 1/1976556‑1977038 | agCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCATACAATGCCAAAAGCCAAGTTTTCATTATCGTTCGTCCCTTTAATTTACTTGTAATTGGTGTAAATAATAGTAAAggcc < 1:174502/250‑4 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AGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTTTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAACCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCATACAATGCCAAAAGCCAAGTTTTCATTATCGTTCGTTCCTTTAATTTACTTGTAATTGGTGTAAATAAGAGTAAAGACCTTTTTCATCTTTCAGTAATTCCTGATGCTTGCCTTGTTCGATGATTTCACCTTTGTCCATCACAATAATGCGATCAGCATTTTTTACAGTAGAAAGGCGGTGAGCAATGATAAGCACAGTACGATTTTGGCAAATTTTATGCATATTATGCATAATGATATTTTCAGATTCGTAATCAAGTGCACTGGTTGCTTCATCAAAAATCAAAATCCTTGGGTTATTGACTAGTGCCC > 1/1976556‑1977038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |