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tGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCATACAATGCCAAAAGCCAAGTTTTCATTATCGTTCGTCCCTTTAATTTACTTGTAATTGGTGTAAATaatag > 1:612330/1‑204 (MQ=255) gATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTtat < 1:243517/118‑1 (MQ=255) aTACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCAcatcat > 1:119488/1‑135 (MQ=255) aTACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCATACAATGCCAAAAGCCAAGTTTTCATTATCGTTCGTCCCTTTAATTTACTTGTAATTGGTGTAAATAATAGTAAAGGCCTTTTTCATCTTTCAGTAATTCTTGATGCTTGCCTTGtt > 1:221448/1‑251 (MQ=255) | CAGTTTTAACAATAGTTCACCCTTTTTCACGTATTCGCCCTCTTTCACAAAAATATGTTTAACCAATGAATTTTCAATCGGTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCAAATTTTCCTGAAGCCGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTTTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAACCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCATACAATGCCAAAAGCCAAGTTTTCATTATCGTTCGTTCCTTTAATTTACTTGTAATTGGTGTAAATAAGAGTAAAGACCTTTTTCATCTTTCAGTAATTCCTGATGCTTGCCTTGTT > 1/1976372‑1976843 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |