| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,976,483 | A→G | F90F (TTT→TTC) | unknown ← | RTX toxin transporter, determinant D |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,976,483 | 0 | A | G | 100.0% | 181.6 / NA | 63 | F90F (TTT→TTC) | unknown | RTX toxin transporter, determinant D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (31/32); total (31/32) | |||||||||||
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ttttCAATCGGTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGttt > 1:301311/1‑250 (MQ=255) cAATCGGTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCAtt > 1:63524/1‑250 (MQ=255) gTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGAt > 1:39697/1‑143 (MQ=255) gTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTc < 1:798591/245‑1 (MQ=255) cTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATaa < 1:813005/251‑1 (MQ=255) tctcCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGaaa > 1:735535/1‑251 (MQ=255) ctcCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAg > 1:823944/1‑251 (MQ=255) cccGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTtat < 1:135867/239‑1 (MQ=255) tAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAGTGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCAcatcat < 1:110157/251‑1 (MQ=255) | CTAATATTGGTAATTGATCTTTTTCAACAGCTTCCAATAAAGATTTATAACGAAATTCCTCCAGTTTAGCTTGAGAAAGCGATGTCTTCGTTTTTAACGTATCCGCTTCGGCACCAAGTGCGGTCAGTTTTAACAATAGTTCACCCTTTTTCACGTATTCGCCCTCTTTCACAAAAATATGTTTAACCAATGAATTTTCAATCGGTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCAAATTTTCCTGAAGCCGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTTTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAACCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCAT > 1/1976248‑1976727 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |