| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,976,309 | C→T | L148L (CTG→CTA) | unknown ← | RTX toxin transporter, determinant D |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,976,309 | 0 | C | T | 100.0% | 170.1 / NA | 59 | L148L (CTG→CTA) | unknown | RTX toxin transporter, determinant D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (27/32); total (27/32) | |||||||||||
TTAATCAGACCTTCATATTTTTTTATTCGTGCCAAATAACTGAGTTTTTCCGCTTCTTTTTTATTAAGATTCAAGGTTTTCTGATGGCGTTGTTTTTGCCAAGTAGAGAATTGTTCTTCAATCAGTAAAGTCACTCTTTTTTGATCGTTTTCCGTCATAAAAGGTAAATCAATTTTAGAAAAATCTAATATTGGTAATTGATCTTTTTCAACAGCTTCCAATAAAGATTTATAACGAAATTCCTCCAGTTTAGCTTGAGAAAGCGATGTCTTCGTTTTTAACGTATCCGCTTCGGCACCAAGTGCGGTCAGTTTTAACAATAGTTCACCCTTTTTCACGTATTCGCCCTCTTTCACAAAAATATGTTTAACCAATGAATTTTCAATCGGTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCAAATTTTCCTGAAGCCGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTA > 1/1976064‑1976550 | ttAATCAAACCCTCATATTTTTTTATTCGTGCCAAATAACTGAGTTTTTCTGCTTCTTTTTTATTAAGATTCAAGGTTTTCTGATGGCGTTGTTTTTGCCAAGTAGAGAATTGCTCTTCAATCAGTAAAGTCACCCTTTTTTGATCGTTTTCCGTCATAAAAGGCAAATCAATTTTAGAAAAATCTAATATTGGTAATTGATCTTTTTCAACAGCTTCCAATAAAGATTTATAACGAAATTCCTCTAGttt < 1:336917/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |