| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,976,198 | T→C | R185R (AGA→AGG) | unknown ← | RTX toxin transporter, determinant D |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,976,198 | 0 | T | C | 100.0% | 158.7 / NA | 56 | R185R (AGA→AGG) | unknown | RTX toxin transporter, determinant D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (26/30); total (26/30) | |||||||||||
AGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTCTCTTCATCTAAAACTGTATGTTTTGCAATAGCA‑TGTTCCTTATATAAGGCTCTAAAATCATCCAATCGGACTTGCTCTGTATTAATCAGACCTTCATATTTTTTTATTCGTGCCAAATAACTGAGTTTTTCCGCTTCTTTTTTATTAAGATTCAAGGTTTTCTGATGGCGTTGTTTTTGCCAAGTAGAGAATTGTTCTTCAATCAGTAAAGTCACTCTTTTTTGATCGTTTTCCGTCATAAAAGGTAAATCAATTTTAGAAAAATCTAATATTGGTAATTGATCTTTTTCAACAGCTTCCAATAAAGATTTATAACGAAATTCCTCCAGTTTAGCTTGAGAAAGCGATGTCTTCGTTTTTAACGTATCCGCTTCGGCACCAAGTGCGGTCAGTTTTAACAATAGTTCACCCTTTTTCACGTATTCGCCCTCTTTCACAAAAATATGTTTAACCAAT > 1/1975953‑1976438 | aGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTTTCTTCATCTAAAACCGTATGTTTTGCAATAGCA‑TGTTCCTTATATAAGGCTCTAAAATCATCCAATCGGACTTGTTCTGTATTAATCAAACCCTCATATTTTTTTATTCGTGCCAAATAACTGAGTTTTTCTGCTTCTTTTTTATTAAGATTCAAGGTTTTCTGATGGCGTTGTTTTTGCCAAGTAGAGAATTGCTCTTCAATCAGTAAAGTCACCCtttt > 1:6896/1‑251 (MQ=255) 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AGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTCTCTTCATCTAAAACTGTATGTTTTGCAATAGCA‑TGTTCCTTATATAAGGCTCTAAAATCATCCAATCGGACTTGCTCTGTATTAATCAGACCTTCATATTTTTTTATTCGTGCCAAATAACTGAGTTTTTCCGCTTCTTTTTTATTAAGATTCAAGGTTTTCTGATGGCGTTGTTTTTGCCAAGTAGAGAATTGTTCTTCAATCAGTAAAGTCACTCTTTTTTGATCGTTTTCCGTCATAAAAGGTAAATCAATTTTAGAAAAATCTAATATTGGTAATTGATCTTTTTCAACAGCTTCCAATAAAGATTTATAACGAAATTCCTCCAGTTTAGCTTGAGAAAGCGATGTCTTCGTTTTTAACGTATCCGCTTCGGCACCAAGTGCGGTCAGTTTTAACAATAGTTCACCCTTTTTCACGTATTCGCCCTCTTTCACAAAAATATGTTTAACCAAT > 1/1975953‑1976438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |