| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,975,586 | G→A | V389V (GTC→GTT) | unknown ← | RTX toxin transporter, determinant D |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,975,586 | 0 | G | A | 100.0% | 180.4 / NA | 63 | V389V (GTC→GTT) | unknown | RTX toxin transporter, determinant D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (39/24); total (39/24) | |||||||||||
TATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTAAGTAGATAGCTTATAACGCTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCGGAAAGTGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATCGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCCGTTAAATAACCATAACGGGTATA‑GGGGAAGGCTTCGACCTTAATTACAACCTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCAGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACTTTTAATTGTTGTACAGTACCTGATACAGGAGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATTGTTTTTGTCCAGTTCGAATGTCAATAAATTCA > 1/1975339‑1975824 | tATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATA‑GGGGAAGGCTTCAAcc < 1:486646/251‑1 (MQ=255) 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ggTATA‑GGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACCTTTAATTGCTGTACAGTACCCGAt > 1:182960/1‑187 (MQ=255) gTATA‑GGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAGGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACCTTTAATTGCTGTACAGTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATTGTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATaa > 1:76974/1‑251 (MQ=255) gTATA‑GGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACCTTTAATTGCTGTACAGTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATTGTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATaa > 1:119013/1‑251 (MQ=255) ata‑GGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACCTTTAATTGCTGTACAGTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATTGTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAAt > 1:756900/1‑251 (MQ=255) ata‑GGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACCTTTAATTGCTGTACAGTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATTGTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAAt > 1:64578/1‑251 (MQ=255) ata‑GGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACCTTTAATTGCTGTACAGTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATTGTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAAt > 1:233036/1‑251 (MQ=255) ggggAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACCTTTAATTGCTGTACAGTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATTGTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTca > 1:846557/1‑251 (MQ=255) | TATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTAAGTAGATAGCTTATAACGCTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCGGAAAGTGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATCGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCCGTTAAATAACCATAACGGGTATA‑GGGGAAGGCTTCGACCTTAATTACAACCTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCAGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACTTTTAATTGTTGTACAGTACCTGATACAGGAGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATTGTTTTTGTCCAGTTCGAATGTCAATAAATTCA > 1/1975339‑1975824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |