| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 287,382 | A→C | G50G (GGA→GGC) | unknown → | Methionine ABC transporter permease protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 287,382 | 0 | A | C | 100.0% | 251.5 / NA | 85 | G50G (GGA→GGC) | unknown | Methionine ABC transporter permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (43/42); total (43/42) | |||||||||||
GTTTTACCGTGGCGGAAGTGGAAGGTGATGAAGACGCCATTACCCAAGCAAAAATCTATTTAATGGAAAATAACGTACGCGTTGAGGTGCTAGGCTATGTGGAATGATTTTTTAACGCAACTTACGCCCCAAATGTGGCAAACAGTGTGGGTTTCCACTTATGAAACCGTGTATATCAGCTTTGCTTCCACGTTTCTGGCGGTGATCGTCGGTTTACCCTTCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGAAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGAA > 1/287137‑287619 | gTTTTACCGTGGCGGAAGTGGAAGGTGATGAAGACGCCATTACCCAAGCAAAAATCTATTTAATGGAAAATAACGTACGCGTTGAGGTGCTAGGCTATGTGGAATGATTTTTTAACGCAACTTACGCCCCAAATGTGGCAAACAGTGTGGGTTTCCACTTATGAAACCGTGTATATCAGCTTTGCTTCCACGTTTCTGGCGGTGATCGTCGGTTTACCCTTCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGCAAAgg > 1:377981/1‑251 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(MQ=255) tGCTTCCACGTTTCTGGCGGTGATCGTCGGTTTACCCTTCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTgg < 1:238936/251‑1 (MQ=255) tCCACGTTTCTGGCGGTGATCGTCGGTTTACCCTTCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGt > 1:699945/1‑225 (MQ=255) ggCGGTGATCGTCGGTTTACCCTTCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCa > 1:651639/1‑251 (MQ=255) aTCGTCGGTTTACCCTTCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAatt < 1:530319/135‑1 (MQ=255) 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aCCCTTCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTAt < 1:446198/198‑1 (MQ=255) tCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCaaaa < 1:783827/251‑1 (MQ=255) tCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCaaaa < 1:266455/251‑1 (MQ=255) 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aCATTCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGa > 1:878671/1‑251 (MQ=255) cATTCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGaa > 1:343945/1‑251 (MQ=255) ttCCTGACCGGCAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTtg < 1:220292/196‑1 (MQ=255) | GTTTTACCGTGGCGGAAGTGGAAGGTGATGAAGACGCCATTACCCAAGCAAAAATCTATTTAATGGAAAATAACGTACGCGTTGAGGTGCTAGGCTATGTGGAATGATTTTTTAACGCAACTTACGCCCCAAATGTGGCAAACAGTGTGGGTTTCCACTTATGAAACCGTGTATATCAGCTTTGCTTCCACGTTTCTGGCGGTGATCGTCGGTTTACCCTTCGGTGTGCTGACATTCCTGACCGGAAAAGGCGAAATTTTACAAAATGCCCGCTTAAATCTGATACTCAACATCGTGATTAATATCGGACGTTCAATTCCATTCATTATTCTGTTAATTATTTTGTTGCCATTTACCCGTTTTGTGTTGAACACCACCCTCGGCACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGAA > 1/287137‑287619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |