| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,959,112 | A→C | Y82D (TAT→GAT) | unknown ← | Inositol transport system ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,959,112 | 0 | A | C | 100.0% | 217.2 / NA | 72 | Y82D (TAT→GAT) | unknown | Inositol transport system ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (31/41); total (31/41) | |||||||||||
AACCGCCGTAGCAATAGCAACTAACTGCGCTTTTGCCACCGATACATCGGACATTTTGGCGGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATAAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTCTAAAATATACGGAGAATTTGAAC > 1/1958867‑1959345 | aaCCGCCGTAGCAATAGCAACTAACTGCGCTTTTGCCACCGATACATCGGACATTTTGGTAGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAg < 1:492298/251‑1 (MQ=255) atagcaaCTAACTGCGCTTTTGCCACCGATACATCGGACATTTTGGCAGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGttt < 1:404180/251‑1 (MQ=255) cTTTTGCCACCGATACATCGGACATTTTGGCAGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTc > 1:641460/1‑250 (MQ=255) ccACCGATACATCGGACATTTTGGCAGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAaat < 1:744952/250‑1 (MQ=255) cagATACATCGGACATTTTGGCAGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAg > 1:34955/3‑230 (MQ=255) cATCGGACATTTTGGCAGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCg > 1:877103/1‑251 (MQ=255) aTCGGACATTTTGGCAGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGCCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGc < 1:71263/251‑1 (MQ=255) cGGACATTTTGGCAGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCca < 1:132475/251‑1 (MQ=255) ggACATTTTGGCAGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCcat > 1:168849/1‑251 (MQ=255) cagTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGat < 1:730231/248‑1 (MQ=255) tCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAg < 1:183038/251‑1 (MQ=255) tCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAg < 1:86193/251‑1 (MQ=255) cACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGa < 1:63625/251‑1 (MQ=255) cACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGa < 1:264343/251‑1 (MQ=255) cACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGa < 1:513271/251‑1 (MQ=255) cACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGa < 1:806901/251‑1 (MQ=255) cACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGa < 1:372300/251‑1 (MQ=255) gTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAg < 1:557342/185‑1 (MQ=255) gCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGc > 1:733530/1‑242 (MQ=255) ctTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAg < 1:122450/182‑1 (MQ=255) ctTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAaat > 1:528619/1‑199 (MQ=255) ctTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATtc > 1:137715/1‑205 (MQ=255) ctTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGa > 1:469093/1‑228 (MQ=255) ctTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTtca < 1:286594/246‑1 (MQ=255) ctTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAg > 1:186701/1‑251 (MQ=255) ctTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAg > 1:653113/1‑251 (MQ=255) cGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAGAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGa > 1:451414/1‑218 (MQ=255) aaGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGc < 1:419275/250‑1 (MQ=255) ccTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCAc < 1:860272/249‑1 (MQ=255) gCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGttt > 1:768351/1‑251 (MQ=255) cATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTc > 1:156268/1‑250 (MQ=255) tttCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAgg < 1:584457/251‑1 (MQ=255) ttCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGc < 1:335002/251‑1 (MQ=255) ttCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGc < 1:856049/251‑1 (MQ=255) ttCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGc < 1:442010/251‑1 (MQ=255) tCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAAc < 1:56878/251‑1 (MQ=255) agaAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACg > 1:803728/1‑249 (MQ=255) agaAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACg > 1:684016/1‑249 (MQ=255) gaAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCGTCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCtt > 1:453418/1‑251 (MQ=255) gaAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGc < 1:80089/186‑1 (MQ=255) gaAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCtt > 1:818865/1‑251 (MQ=255) aCTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGt < 1:223628/251‑1 (MQ=255) ggcttggGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACACCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTa > 1:41502/1‑251 (MQ=255) cttggGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTAcg < 1:473586/251‑1 (MQ=255) gggTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGa > 1:692102/1‑251 (MQ=255) ttCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGa > 1:536239/1‑161 (MQ=255) aCGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGc < 1:737130/251‑1 (MQ=255) aCGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGc < 1:857682/251‑1 (MQ=255) cccTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGgac > 1:456688/1‑95 (MQ=255) ccTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTc < 1:244334/251‑1 (MQ=255) aaGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGc < 1:684563/133‑1 (MQ=255) aaGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATAc > 1:728472/1‑159 (MQ=255) aaGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGc < 1:822240/162‑1 (MQ=255) aaGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAgg < 1:119945/175‑1 (MQ=255) gTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATAc > 1:818994/1‑157 (MQ=255) aaaaaTTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGcc < 1:81877/251‑1 (MQ=255) aaTTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCtt > 1:246334/1‑250 (MQ=255) aTTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTtca > 1:143453/1‑161 (MQ=255) aaTTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGttttt > 1:657064/1‑251 (MQ=255) aaTTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGttttt > 1:795229/1‑251 (MQ=255) gAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCa < 1:577045/250‑1 (MQ=255) aTTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTc < 1:538125/251‑1 (MQ=255) cGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTCTAAAatat < 1:270583/251‑1 (MQ=255) tGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAg > 1:73358/1‑116 (MQ=255) tGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTCTAAAATATACGGAGaa > 1:213518/1‑251 (MQ=255) ttAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTCTAAAATATACGGAGAAtt < 1:820656/250‑1 (MQ=255) tAAGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTCTAAAATATACGGAGAATTTg < 1:50557/251‑1 (MQ=255) aGCCGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTCTAAAATATACGGAGAATTTGaa > 1:365369/1‑251 (MQ=255) ccGCAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTCTAAAATATACGGAGAATTTGAAc < 1:301980/250‑1 (MQ=255) cAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGt < 1:612687/156‑1 (MQ=255) cAACGAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCAc < 1:528185/191‑1 (MQ=255) gAATCGCATCAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTCTaaaa > 1:504591/1‑225 (MQ=255) | AACCGCCGTAGCAATAGCAACTAACTGCGCTTTTGCCACCGATACATCGGACATTTTGGCGGTCACGTCCATCGGCACGCCAAGCTCTTTTAATATCGCCGAAGCCTGCTCATCCATTGCTTTCTGATCGAGAAAAAACTTGGCTTGGGTAATTTCACGCCCTAAGTAAAAATTATCGGCGATGGTCAAATTGGCAGCCGGGGAAATTTCCTGCGGCACCATGGTTAAGCCGCAACGAATCGCATAAATAGGACGACTTGGTTTAAAGGGTTTGCCGTCCAAAATTAATTCTCCGCCATCATCCGGGATATAGATGCCATACAGCACTTTCATCAAGGTGGATTTCCCGGCACCGTTTTCCCCCATTAAGGCATGAACGCTTCCACGTTTTACGCGAAGATTAATGCCGTCAAGTGCCTTCACCCCCGGAAATGTTTTTGACACATTTCGCATTTCTAAAATATACGGAGAATTTGAAC > 1/1958867‑1959345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |