| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,950,783 | C→T | G268G (GGC→GGT) | unknown → | Protein translocase subunit SecF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,950,783 | 0 | C | T | 100.0% | 240.3 / NA | 79 | G268G (GGC→GGT) | unknown | Protein translocase subunit SecF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (33/46); total (33/46) | |||||||||||
TACTTGCAAATTGAAATGGATTTAACCTTTATCGCAGCGATTCTTTCCGTGGTGGGCTATTCCCTCAATGACAGTATCGTGGTATTCGATCGTGTGCGTGAGAACTTCCGTAAAATCAGACGGATTGCTTCTATCGACATTATTAACATTTCATTAACACAAACTCTCTCCCGAACTATTATGACTTCAGTGACGACGTTAATTGTGGTGATCGCCCTTTTTGTCTTCGGCGGCCCGACAATCCATAGTTTCTCGTTGGCCCTCTTAATAGGTATCGGATTCGGGACATACTCTTCTATCTTCGTTGCGATTGCTATTGCATATGACTTAGGTCTTGACCGTGAACACATGGTGCAACCCAAAGTGAACAAAGATGATATTGATGAGCTGCCTTAGTCAATAACAAAAGTGCGGTTAAAATTCATAGTGAATTTCGACCGCACTTTTTACTTTCAAATTTTTCAATAGAATAAGAC > 1/1950550‑1951025 | tACTTGCAAATTGAAATGGATTTAACCTTTATCGCAGCGATTCTTTCCGTGGTGGGCTATTCCCTCAATGACAGTATCGTGGTATTCGATCGTGTGCGTGAGAACTTCCGTAAAATCAGACGGATTGCTTCTATCGACATTATTAACATTTCATTAACACAAACTCTCTCCCGAACTATTATGACTTCAGTGACGACGTTAATTGTGGTGATCGCCCTTTTTGTCTTCGGCGGTCCGACAATCCATAGttt < 1:44979/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |