| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,930,299 | C→G | intergenic (+9/‑169) | unknown → / → unknown | Ribose‑phosphate pyrophosphokinase (EC 2.7.6.1)/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,930,299 | 0 | C | G | 100.0% | 256.6 / NA | 91 | intergenic (+9/‑169) | unknown/unknown | Ribose‑phosphate pyrophosphokinase (EC 2.7.6.1)/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (33/58); total (33/58) | |||||||||||
GTGCAAGACGGGTATTCGCCTATGCCACCCACGCCGTATTCTCAGGCTCTGCGGCAAAAAATATTGCCAGCGATGCCCTTGACGAAGTAGTCGTCACTGACACCATCCCACTTTCTCCGGAAATCCGCGTATTAGGCAAAGTCCGCACCTTAACCTTATCCGGTATGCTTGCCGAAGCTATTCGTCGCATCAGCAACGAAGAGTCCATTTCCGCAATGTTTAACGAATAATAAAAAAACACCCGTAAAAACCACCGCACTTTAAACTACAAAAGGTTTAGCAAAAACTAAACCTTTTGTTTTTTATACGTTATGCCGAACTAACTGCCCGCCACATTGTTGTGCTATAATCGCGCCACATTTAATTTAACAACCCATTTTATTTTAATTTATCAGTAAAGGTGTTCCATGAAAAAATTACTTTTTGTCCTCGCCGGCATTTTAACCATCGCCGCCTGCTCCCAGCCAAAAGACATCTATTTTAAC > 1/1930061‑1930545 | ttgCAAGACGGGTATTCGCCTATGCCACCCACGCCGTATTCTCAGGCTCTGCGGCAAAAAATATTGCCAGCGATGCCCTTGACGAAGTAGTCGTCACTGACACCATCCCACTTTCTCCGGAAATCCGCGTATTAGGCAAAGTCCGCACCTTAACCTTATCCGGTATGCTTGCCGAAGCTATTCGTCGCATCAGCAACGAAGAGTCCATTTCCGCAATGTTTAACGAATAATAAAAAAAGACCCGTAAAAac < 1:202195/250‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |