| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,927,801 | A→G | T13A (ACC→GCC) | unknown → | Outer membrane lipoprotein component of lipoprotein transport system LolB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,927,801 | 0 | A | G | 100.0% | 203.6 / NA | 69 | T13A (ACC→GCC) | unknown | Outer membrane lipoprotein component of lipoprotein transport system LolB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (36/33); total (36/33) | |||||||||||
GCATTAAAAGTGGATATTCAATCCATCATCGCGGCAGGCTTTGAAAATAAAGCCATTCGCGATCAGTTAAACCGCGGACGGATTTTCGCCGTGAAGCAAAAACGCACGGAAATCCTACCGCACTTTAAACCATCGACATCAGATTGCCGCCCTCGTTGCGAACCGTAAAATAACCACCATTTTCTGGGGATAAAAATTGTTTATGAAAAAATTAAAATCCTACGTTTTACTTGTGTTAACCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATAACAACCCACGCGATTACACCCTGCAACTGTATTCCACCATCAGCAGCGAAAC > 1/1927563‑1928045 | gcATTAAAAGTGGATATTCAATCCATCATCGCGGCAGGCTTTGAAAATAAAGCCATTCGCGATCAGTTAAACCGCGGACGGATTTTCGCCGTGAAGCAAAAACGCACGGAAATCCTACCGCACTTTAAACCATCGACATCAGATTGCCGCCCTCGTTGCGAACCGTAAAATAACCACCATTTTCTGGGGATAAAAATTGTTTATGAAAAAATTAAAATCCTACGTTTTACTTGTGTTAGCCGTGTTAtttt > 1:824680/1‑251 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(MQ=255) tCCTACGTTTTACTTGTGTTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATAACAACCCACGCGATTACACCCTGCAACTGTATTccac < 1:647030/251‑1 (MQ=255) gTTTTACTTGTGTTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATAACAACCCAcgcg < 1:901137/220‑1 (MQ=255) ttttACTTGTGTTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTTCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATAACAACCCACGCGATTacac < 1:453668/226‑1 (MQ=255) ttttACTTGTGTTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATcagc < 1:875910/167‑1 (MQ=255) tgtgTTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATc < 1:591494/157‑1 (MQ=255) tgtgTTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATAACAACCCACGCGATTACACCCTGCAACTGTATTCCACCATCAGCAGCGaaa > 1:392134/1‑251 (MQ=255) gtgtTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAgg < 1:453439/133‑1 (MQ=255) gtgtTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATc > 1:686642/1‑156 (MQ=255) gtgtTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATaac < 1:854637/201‑1 (MQ=255) gtgtTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATaa > 1:784578/1‑200 (MQ=255) gtgtTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATAACAACCCACGCGATTACACCCTGCAACTGTATTCCACCATca < 1:604617/241‑1 (MQ=255) gtgtTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATAACAACCCACGCGATTACACCCTGCAACTGTATTCCACCATCAGCAGCGaaa > 1:103207/1‑250 (MQ=255) tgtTAGCCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATAACAACCCACGCGATTACACCCTGCAACTGTATTCCACCATCAGCAGCGAAAc > 1:299087/1‑250 (MQ=255) | GCATTAAAAGTGGATATTCAATCCATCATCGCGGCAGGCTTTGAAAATAAAGCCATTCGCGATCAGTTAAACCGCGGACGGATTTTCGCCGTGAAGCAAAAACGCACGGAAATCCTACCGCACTTTAAACCATCGACATCAGATTGCCGCCCTCGTTGCGAACCGTAAAATAACCACCATTTTCTGGGGATAAAAATTGTTTATGAAAAAATTAAAATCCTACGTTTTACTTGTGTTAACCGTGTTATTTTTAACCGCTTGCGTCACCGATCAGGAACGTCCGACTAACGTAAAATACATCGAAAAAACCGACCGCACTTGGCAGCAGCATTTCACCCAATTAAAACAAATTCAAGGTTATCAGGCGCTTGGGCAGTTAGGTTATATCAGCAGCAAAGAACGCTTTTCCACGCGCTTCGACTGGCAATATAACAACCCACGCGATTACACCCTGCAACTGTATTCCACCATCAGCAGCGAAAC > 1/1927563‑1928045 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |