| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,901,821 | C→T | S302S (AGC→AGT) | unknown → | Inner membrane protein YebS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,901,821 | 0 | C | T | 100.0% | 233.0 / NA | 81 | S302S (AGC→AGT) | unknown | Inner membrane protein YebS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (38/43); total (38/43) | |||||||||||
ATTTACGTTATTGTCATTCCTGCCAATATAGCTTTATTAATCCGCTCACCGATCGCAAAGGGCGCGAAATCTGTCCGCGTTGCTATTCGCAAATTGATTTGCCAAACGCCATTAAATTACAACGCACCTGGGCGCTATTAATTGCGGGTATTATCATGCTGTTTCCGGCAAATTTATTGCCGATGTCGGTGATTTATTTAAACGGTGCGCCAAGTACGGACACCTTAATGTCGGGCGTGATCAGCTTTATTGATATGGGCAGTTACTTCATTGCTTTTGTGGTATTTACCGCCAGTATTTTCGTGCCCATTAGCAAAGTGTTGATTATGTTGTACCTGCTCACCTGCATACACTTTAAACTGAAACATTCTATTCGCTGGCAAATGCGTTTGTTGCATATCGTGCATTTCGTCGGACGCTGGTCAATGCTTGATTTATTCGTATTGGCACTGATGATGTCTTTGGTTACCCGAGGGCAGATTATCGAC > 1/1901577‑1902064 | aTTTACGTTATTGTCATTCCTGCCAATATAGCTTTATTAATCCGCTCACCGATCGCAAAGGGCGCGAAATCTGTCCGCGTTGCTATTCGCAAATTGATTTGCCAAACGCCATTAAATTACAACGCACCTGGGCGCTATTAATTGCGGGTATTATCATGCTGTTTCCGGCAAATTTATTGCCGATGTCGGTGATTTATTTAAACGGTGCGCCAAGTACGGACACCTTAATGTCGGGCGTGATCAGTTTTAt < 1:61847/250‑1 (MQ=255) 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ATTTACGTTATTGTCATTCCTGCCAATATAGCTTTATTAATCCGCTCACCGATCGCAAAGGGCGCGAAATCTGTCCGCGTTGCTATTCGCAAATTGATTTGCCAAACGCCATTAAATTACAACGCACCTGGGCGCTATTAATTGCGGGTATTATCATGCTGTTTCCGGCAAATTTATTGCCGATGTCGGTGATTTATTTAAACGGTGCGCCAAGTACGGACACCTTAATGTCGGGCGTGATCAGCTTTATTGATATGGGCAGTTACTTCATTGCTTTTGTGGTATTTACCGCCAGTATTTTCGTGCCCATTAGCAAAGTGTTGATTATGTTGTACCTGCTCACCTGCATACACTTTAAACTGAAACATTCTATTCGCTGGCAAATGCGTTTGTTGCATATCGTGCATTTCGTCGGACGCTGGTCAATGCTTGATTTATTCGTATTGGCACTGATGATGTCTTTGGTTACCCGAGGGCAGATTATCGAC > 1/1901577‑1902064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |