| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,846,996 | C→T | E154E (GAG→GAA) | unknown ← | dTDP‑4‑dehydrorhamnose reductase (EC 1.1.1.133) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,846,996 | 0 | C | T | 100.0% | 215.0 / NA | 72 | E154E (GAG→GAA) | unknown | dTDP‑4‑dehydrorhamnose reductase (EC 1.1.1.133) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (32/40); total (32/40) | |||||||||||
TTGCGAAACAGCTTCATCAAAAATTGCTCTGGCAAAATCACACCAGCTGACATAAGGTTCCCCCGTAAAGTGA‑TAAATACCATATTCAACAGATTCGCCTGCAATGATTTTTTCTGCAATTTGAATTAACGCAGCGGCAATATCTCCTGCATAGGTCGGTCCGCCGATCTGATCAGCAACTACGCCTAAAGTGTCACGAGTTTTGGCTAAACGCAGCATTGTTTTAACGAAATTGCTGCCGTGCTCGCAGAATACCCAAGCGGTACGCAATACGATAAATTTATCGTTTGCTTCTACAACGGCTTGTTCGCCCGCTAGTTTGGTTTTGCCGTAAATACCTTGCGGATCGACTGCATCAGTTTCTTTGTATTTACCTGCACGCCGCCCGTCAAAAACATAGTCTGTTGAAATATGTAAAATTGCTGCACCAACACTTTTCGCGGTTTCCGCCAAGTATTGCGGACCTTTTACATTAATGGCCTCGGAAA > 1/1846753‑1847240 | ttGCGAAACAGCTTCATCAAAAATTGCTCTGGCAAAATCACACCAGCTGACATAAGGTTCCCCCGTAAAGTGA‑TAAATACCATATTCAACAGATTCGCCTGCAATGATTTTTTCTGCAATTTGAATTAACGCAGCGGCAATATCTCCTGCATAGGTCGGTCCGCCGATCTGATCAGCAACTACGCCTAAAGTGTCACGAGTTTTGGCTAAACGCAGCATTGTTTTAACGAAATTGCTGCCGTGTTCGCAGa < 1:357289/251‑1 (MQ=255) 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1:106023/1‑251 (MQ=255) gcaTTGTTTTAACGAAATTGCTGCCGTGTTCGCAGAATACCCAAGCGGTACGCAATACGATAAATTTATCGTTTGCTTCTACAACGGCTTGTTCGCCCGCTAGTTTGGTTTTGCCGTAAATACCTTGCGGATCGACTGCATCAGTTTCTTTGTATTTACCTGCACGCCGCCCGTCAAAAACAt < 1:367171/183‑1 (MQ=255) gTTTTAACGAAATTGCTGCCGTGTTCGCAGAATACCCAAGCGGTACGCAATACGATAAATTTATCGTTTGCTTCTACAACGGCTTGTTCGCCCGCTAGTTTGGTTTTGCCGTAAATACCTTGCGGATCGACTGCATCAGTTTCTTTGTATTTACCTGCACGCCGCCCGTCAAAAACATAGTCTGTTGAAATATGTAAAATTGCTGCACCAACACTTTTCGCGGTTTCCGCCAAGTATTGCGGACCTTTTa > 1:354397/1‑250 (MQ=255) ttttAACGAAATTGCTGCCGTGTTCGCAGAATACCCAAGCGGTACGCAATACGATAAATTTATCGTTTGCTTCTACAACGGCTTGTTCGCCCGCTAGTTTGGTTTTGCCGTAAATACCTTGCGGATCGACTGCATCAGTTTCTTTGTATTTACCTGCACGCCGCCCGTCAAAAACATAGTCTGTTGAAATATGTAAAATTGCTGCACCAACACTTTTCGCGGTTTCCGCCAAGTATTGCGGACCTTTTACa < 1:575884/251‑1 (MQ=255) ttttAACGAAATTGCTGCCGTGTTCGCAGAATACCCAAGCGGTACGCAATACGATAAATTTATCGTTTGCTTCTACAACGGCTTGTTCGCCCGCTAGTTTGGTTTTGCCGTAAATACCTTGCGGATCGACTGCATCAGTTTCTTTGTATTTACCTGCACGCCGCCCGTCAAAAACATAGTCTGTTGAAATATGTAAAATTGCTGCACCAACACTTTTCGCGGTTTCCGCCAAGTATTGCGGACCTTTTACa < 1:272902/251‑1 (MQ=255) ttGCTGCCGTGTTCGCAGAATACCCAAGCGGTACGCAATACGATAAATTTATCGTTTGCTTCTACAACGGCTTGTTCGCCCGCTAGTTTGGTTTTGCCGTAAATACCTTGCGGATCGACTGCATCAGTTTCTTTGTATTTACCTGCACGCCGCCCGTCAAAAACATAGTCTGTTGa > 1:668175/1‑176 (MQ=255) gcCGTGTTCGCAGAATACCCAAGCGGTACGCAATACGATAAATTTATCGTTTGCTTCTACAACGGCTTGTTCGCCCGCTAGTTTGGTTTTGCCGTAAATACCTTGCGGATCGACTGCATCAGTTTCTTTGTATTTACCTGCACGCCGCCCGTCAAAAACATAGTCTGTTGAAATATGTAAAATTGCTGCACCAACACTTTTCGCGGTTTCCGCCAAGTATTGCGGACCTTTTACATTAATGGCCTCGGaaa > 1:280544/1‑251 (MQ=255) | TTGCGAAACAGCTTCATCAAAAATTGCTCTGGCAAAATCACACCAGCTGACATAAGGTTCCCCCGTAAAGTGA‑TAAATACCATATTCAACAGATTCGCCTGCAATGATTTTTTCTGCAATTTGAATTAACGCAGCGGCAATATCTCCTGCATAGGTCGGTCCGCCGATCTGATCAGCAACTACGCCTAAAGTGTCACGAGTTTTGGCTAAACGCAGCATTGTTTTAACGAAATTGCTGCCGTGCTCGCAGAATACCCAAGCGGTACGCAATACGATAAATTTATCGTTTGCTTCTACAACGGCTTGTTCGCCCGCTAGTTTGGTTTTGCCGTAAATACCTTGCGGATCGACTGCATCAGTTTCTTTGTATTTACCTGCACGCCGCCCGTCAAAAACATAGTCTGTTGAAATATGTAAAATTGCTGCACCAACACTTTTCGCGGTTTCCGCCAAGTATTGCGGACCTTTTACATTAATGGCCTCGGAAA > 1/1846753‑1847240 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |