| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,810,623 | G→A | intergenic (‑195/‑146) | unknown ← / → unknown | hypothetical protein/Cytochrome c551 peroxidase (EC 1.11.1.5) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,810,623 | 0 | G | A | 100.0% | 28.7 / NA | 12 | intergenic (‑195/‑146) | unknown/unknown | hypothetical protein/Cytochrome c551 peroxidase (EC 1.11.1.5) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (5/7); total (5/7) | |||||||||||
TAGTAAGAGCAAGTACGCCGGTTAATAAATTAATTTTTTTCATGATAAACTCCTTAAATAATAGTATTAAATGTAAAAATATTTTGCTTGAATAAGCACGAAGTGAAAAAGTCATAATAAACTCCCACACACATAATGTTAGACGGAGACATTTCCATTTTCTTACAAAAAATTTTTTAAAATTTGCAAATCAACCTAAAAAACAGATACTCTCATATAAAAATATATTTATAGTGAGCGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGCGGTTGTCGCTATTGTTGGCTATTTAGGAGTTGTAGGGTACGTTCATCAGTATGATAAAGGACAAATG > 1/1810386‑1810861 | tAGTAAGAGCAAGTACGCCGGTTAATAAATTAATTTTTTTCATGATAAACTCCTTAAATAATAGTATTAAATGTAAAAATATTTTGCTTGAATAAGCACGAAGTGAAAAAGTCATAATAAACTCCCACACACATAATGTTAGACGGAGACATTTCCATTTTCTTACAAAAAATTTTTTAAAATTTGCAAATCAACCTAAAAAACAGATACTCTCATATAAAAATATATTTATAGTGAACGCTCTAAATa > 1:348316/1‑249 (MQ=255) cccACACACATAATGTTAGACGGAGACATTTCCATTTTCTTACAAAAAATTTTTTAAAATTTGCAAATCAACCTAAAAAACAGATACTCTCATATAAAAATATATTTATAGTGAACGCTCTAAATa > 1:592286/1‑126 (MQ=255) aGACGGAGACATTTCCATTTTCTTACAAAAAATTTTTTAAAATTTGCAAATCAACCTAAAAAACAGATACTCTCATATAAAAATATATTTATAGTGAACGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGaaaaa > 1:74917/1‑251 (MQ=255) cATTTCCATTTTCTTACAAAAAATTTTTTAAAATTTGCAAATCAACCTAAAAAACAGATACTCTCATATAAAAATATATTTATAGTGAACGCTCTAAATAGa < 1:82592/102‑1 (MQ=255) tttAAAATTTGCAAATCAACCTAAAAAACAGATACTCTCATATAAAAATATATTTATAGTGAACGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGCGGTTGTCGCTAttgttg < 1:573517/251‑1 (MQ=255) aaaTCAACCTAAAAAACAGATACTCTCATATAAAAATATATTTATAGTGAACGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGTGGTTGTCGCTATTGTTGGCTATTTAGGAg < 1:220556/251‑1 (MQ=255) tctcATATAAAAATATATTTATAGTGAACGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGCGGTTGTCGCTATTGTTGGCTATTTAGGAGTTGTAGGGTACGTTCATCAGTAt < 1:234603/251‑1 (MQ=255) tataAAAATATATTTATAGTGAACGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGCGGTTGTCGCTATTGTTGGCTATTTAGGAGTTGTAGGGTACGTTCATCAGTATGATaa < 1:602132/251‑1 (MQ=255) aaaTATATTTATAGTGAACGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGCGGTTGTCGCTATTGTTGGCTATTTAGGAGTTGTAGGGTACGTTCATCAGTATGATAAAGGAc < 1:595476/251‑1 (MQ=255) tatTTATAGTGAACGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGCGGTTGt < 1:611379/190‑1 (MQ=255) tatTTATAGTGAACGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGCGGTTGTCGCTATTTTTGGCTATTTAGGAGTTGTAGGGGACGtt > 1:718123/1‑227 (MQ=255) tatTTATAGTGAACGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGCGGTTGTCGCTATTGTTGGCTATTTAGGAGTTGTAGGGTACGTTCATCAGTATGATaaatgtctcttt > 1:65875/1‑242 (MQ=255) | TAGTAAGAGCAAGTACGCCGGTTAATAAATTAATTTTTTTCATGATAAACTCCTTAAATAATAGTATTAAATGTAAAAATATTTTGCTTGAATAAGCACGAAGTGAAAAAGTCATAATAAACTCCCACACACATAATGTTAGACGGAGACATTTCCATTTTCTTACAAAAAATTTTTTAAAATTTGCAAATCAACCTAAAAAACAGATACTCTCATATAAAAATATATTTATAGTGAGCGCTCTAAATAGATATTTAATTACTAAAATCTATTTCATCCATTGTTTTTTCAAATTGAATTTATTGATTTAAATCATATGTTTCCTCTTATATTTAACCGATAATCCCTTCTTCGTTTTTACTTTTAAGTGTTGGAGGACAATTATGAAAAAATTTGCACTGAAAACGGCGGTTGTCGCTATTGTTGGCTATTTAGGAGTTGTAGGGTACGTTCATCAGTATGATAAAGGACAAATG > 1/1810386‑1810861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |