| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,800,187 | T→C | intergenic (‑272/‑21) | unknown ← / → unknown | UPF0299 membrane protein YohJ/tRNA‑Leu‑CAA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,800,187 | 0 | T | C | 100.0% | 159.4 / NA | 54 | intergenic (‑272/‑21) | unknown/unknown | UPF0299 membrane protein YohJ/tRNA‑Leu‑CAA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (35/19); total (35/19) | |||||||||||
CATAGTGAAAACTCAACTTTTTTTTAATATTTAAAATAATTCTACTCTTATTTTACAAGAAGGGGAATTTTTTCCGGAAAGCCACTACACTAGTAGAAAAGAAGGTAAGGGAAAAATTTCACATAGATCAAAATTATTGAATGTGTTGAATTTTAAACAGTTAAACAAAATTGCAAAGTTTTTGCTTGCAACTGAAACATAATCCCTTATAATACCGCTCGTTTTTACGAAGCTTATCAATGCTGCCTGGGTGGCGAAATTGGTAGACGCAGCGGATTCAAAATCCGCCGTTGAATAAACGTGTCGGTTCGAGTCCGACCCTAGGCACCAATGATAAGTTTCTGAAAAATTAAAGCTGCCGTAAAACGCAGCTTTTTTTGTCACTTGAAGTTAACCCTTCCCTTAAAATTTACCGGAAAAAATGACCGCACTTTTAGCGCCGTTATCAATTATGCGACA > 1/1799964‑1800422 | cATAGTGAAAACTCAACTTTTTTTTAATATTTAAAATAATTCTACTCTTATTTTACAAGAAGGGGAATTTTTTCCGGAAAGCCACTACACTAGTAGAAAAGAAAGTAAGGGAAAAATTTCACATAGATCAAAATTATTGAATGTGTTGAATTTTAAACAGTTAAACAAAATTGCAAAGTTTTTGCTTGCAACTGAAACATAATCCCTTATAATACCGCTCGTTCTTACGAAGCTTATCaa < 1:901771/240‑1 (MQ=255) atTCTACTCTTATTTTACAAGAAGGGGAATTTTTTCCGGAAAGCCACTACACTAGTAGAAAAGAAAGTAAGGGAAAAATTTCACATAGATCAAAATTATTGAATGTGTTGAATTTTAAACAGTTAAACAAAATTGCAAAGTTTTTGCTTGCAACTGAAACATAATCCCTTATAATACCGCTCGTTCTTACGa > 1:48023/1‑192 (MQ=255) 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CATAGTGAAAACTCAACTTTTTTTTAATATTTAAAATAATTCTACTCTTATTTTACAAGAAGGGGAATTTTTTCCGGAAAGCCACTACACTAGTAGAAAAGAAGGTAAGGGAAAAATTTCACATAGATCAAAATTATTGAATGTGTTGAATTTTAAACAGTTAAACAAAATTGCAAAGTTTTTGCTTGCAACTGAAACATAATCCCTTATAATACCGCTCGTTTTTACGAAGCTTATCAATGCTGCCTGGGTGGCGAAATTGGTAGACGCAGCGGATTCAAAATCCGCCGTTGAATAAACGTGTCGGTTCGAGTCCGACCCTAGGCACCAATGATAAGTTTCTGAAAAATTAAAGCTGCCGTAAAACGCAGCTTTTTTTGTCACTTGAAGTTAACCCTTCCCTTAAAATTTACCGGAAAAAATGACCGCACTTTTAGCGCCGTTATCAATTATGCGACA > 1/1799964‑1800422 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |