| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,786,627 | G→A | E33K (GAA→AAA) | unknown → | Putative efflux (PET) family inner membrane protein YccS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,786,627 | 0 | G | A | 100.0% | 186.4 / NA | 65 | E33K (GAA→AAA) | unknown | Putative efflux (PET) family inner membrane protein YccS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (32/33); total (32/33) | |||||||||||
TGGCGCATTTCAAAATCGCCGCCATCGCATTATATCCGGTGGGACAACGCGTGTTGCCGAAAGACACTGCCGACTTAATCCGCCAACAATTCACCGAACAACAATACAAGCAGTTTTATAAATAAGGTTAAACATGAATCGCTGGTTTAACGCCAAAGTTATTGCGTCCATTCCGATTTTTATCGCCGTAAATCTCGCGGTGCTGGCAATTTGGTATTTTAATATTTCCGAACAAAGCATGCCTTTGGTGCTGGGCATTATTGCCGGCGGATTAGTGGATTTGGATAACCGGTTAACCGGCCGTATTAAAAACGTATTTTACACCCTGCTCGCTTTCTCCGTTTCAACCCTAAGCGTGCAACTGAGCATTGGGCATAACCTGCAATTTATGCTGTTAATGACGCTCATGACCTTTGCCTTCACCATGATCGGCGCTTTGGGGCAGCGTTACAGCACCATCGCTTTCG > 1/1786398‑1786864 | tGGCGCATTTCAAAATCGCCGCCATCGCATTATATCCGGTGGGACAACGCGTGTTGCCGAAAGACACTGCCGCCTTAATCCGCCAACAATTCACCGAACAACAATACAAGCAGTTTTATAAATAAGGTTAAACATGAATCGCTGGTTTAACGCCAAAGTTATTGCGTCCATTCCGATTTTTATCGCCGTAAATCTCGCGGTGCTGGCAATTTGGTATTTTAATATTTCCAAACAAAGCATGCCTTTGGTGc < 1:225620/251‑1 (MQ=255) 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ttttAATATTTCCAAACAAAGCATGCCTTTGGTGCTGGGCATTATTGCCGGCGGATTAGTGGATTTGGATAACCGGTTAACCGGCCGTATTAAAAACGTATTTTACACCCTGCTCGCTTTCTCCGTTTCAACCCTAAGCGTGCAACTGAGCATTGGGCATAACCTGCAATTTATGCTGTTAATGACGCTCATGACCTTTGCCTTCACCATGATCGGCGCTTTGGGGCAGCGTTACAGCACCATCGCTTTCg > 1:382345/1‑251 (MQ=255) tAATATTTCCAAACAAAGCATGCCTTTGGTGCTGGGCATTATTGCCGGCGGATTAGTGGATTTGGATAACCGGTTAACCGGCCGTATTAAAAACGTATTTTACACCCTGCTCGCTTTCTCCGTTTCAACCCTAAGCGTGCAACTGAGCATTGGGCATAACCTGCAATTTATGCTg > 1:41470/1‑175 (MQ=255) aaTATTTCCAAACAAAGCATGCCTTTGGTGCTGGGCATTATTGCCGGCGGATTAGTGGATTTGGATAACCGGTTAACCGGCCGTATTAAAAACGTATTTTACACCCTGCTCGCTTTCTCCGTTTCAACCCTAAGCGTGCAACTGAGCAt > 1:6235/1‑149 (MQ=255) tttCCAAACAAAGCATGCCTTTGGTGCTGGGCATTATTGCCGGCGGATTAGTGGATTTGGATAACCGGTTAACCGGCCGTATTAAAAACGTATTTTACACCCTGCTCGCTTTCTCCGTTTCAACCCTAAGCGTGCAACTGAGCATTGGGCATAACCTGCAATTTATGCTGTTAATGACGCTCATGACCTTTGCCTTCACCATGATc > 1:259574/1‑206 (MQ=255) tttCCAAACAAAGCATGCCTTTGGTGCTGGGCATTATTGCCGGCGGATTAGTGGATTTGGATAACCGGTTAACCGGCCGTATTAAAAACGTATTTTACACCCTGCTCGCTTTCTCCGTTTCAACCCTAAGCGTGCAACTGAGCATTGGGCATAACCTGCAATTTATGCTGTTAATGACGCTCATGACCTTTGCCTTCACCATGATCgg < 1:782468/208‑1 (MQ=255) | TGGCGCATTTCAAAATCGCCGCCATCGCATTATATCCGGTGGGACAACGCGTGTTGCCGAAAGACACTGCCGACTTAATCCGCCAACAATTCACCGAACAACAATACAAGCAGTTTTATAAATAAGGTTAAACATGAATCGCTGGTTTAACGCCAAAGTTATTGCGTCCATTCCGATTTTTATCGCCGTAAATCTCGCGGTGCTGGCAATTTGGTATTTTAATATTTCCGAACAAAGCATGCCTTTGGTGCTGGGCATTATTGCCGGCGGATTAGTGGATTTGGATAACCGGTTAACCGGCCGTATTAAAAACGTATTTTACACCCTGCTCGCTTTCTCCGTTTCAACCCTAAGCGTGCAACTGAGCATTGGGCATAACCTGCAATTTATGCTGTTAATGACGCTCATGACCTTTGCCTTCACCATGATCGGCGCTTTGGGGCAGCGTTACAGCACCATCGCTTTCG > 1/1786398‑1786864 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |