| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,773,041 | C→T | G258G (GGC→GGT) | unknown → | 5‑methyltetrahydropteroyltriglutamate‑‑ homocysteine methyltransferase (EC 2.1.1.14) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,773,041 | 0 | C | T | 100.0% | 201.5 / NA | 71 | G258G (GGC→GGT) | unknown | 5‑methyltetrahydropteroyltriglutamate‑‑ homocysteine methyltransferase (EC 2.1.1.14) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (34/37); total (34/37) | |||||||||||
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ttCGGTTCTGTCGCGGAACACGCTGCGTTATTAAAAGCCTTGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCacac < 1:523944/251‑1 (MQ=255) gTTCTGTCGCGGAACACGCTGCGTTATTAAAAGCCTTGCCGGTTGCGGGTTTAcaca > 1:713183/1‑57 (MQ=255) tGTCGCGGAACACGCTGCGTTATTAAAAGCCTTGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACACCCCTTATg < 1:393899/251‑1 (MQ=255) tGTCGCGGAACACGCTGCGTTATTAAAAGCCTTGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTGCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACACCCCTTATg < 1:359492/251‑1 (MQ=255) 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attaAAAGCCTTGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACAcc > 1:569599/1‑223 (MQ=255) attaAAAGCCTTGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACACCCCTTATGATTTATCGGTGGAAACACAGt > 1:688414/1‑251 (MQ=255) gCCTTGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACACCCCTTATGAt > 1:869785/1‑225 (MQ=255) ccTTGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACACCCCTTATGATTTATCGGTGGAAACACAGTTACAAg < 1:580466/249‑1 (MQ=255) tGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACACCCCTTATGATTTATCGGTGGAAACACAGTTACAAGTaaac < 1:199014/251‑1 (MQ=255) tGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACACCCCTTATGATTTATCGGTGGAAACACAGTTACAAGTaaac < 1:877018/251‑1 (MQ=255) tGCCGGTTGCGGGTTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACACCCCTTATGATTTATCGGTGGAAACACAGTTACAAGTaaac < 1:103391/251‑1 (MQ=255) | TTGATTTATTAAATAAACTCATACCGGTTTATGTAGAAATCTTAAACGCATTGGCAGCAGAAGGCGTGGATTATATTCAAATTGACGAACCTGCTTTAACTGTCGATTTGCCGGCTAAATGGGTTGCGGCTTATAAAGACGTGTACGCCACATTAAGCACACAAGTAAACGCAAAATTACTGTTAGCCACTTATTTCGGTTCTGTCGCGGAACACGCTGCGTTATTAAAAGCCTTGCCGGTTGCGGGCTTACACATTGATTTAGTGCGTGCGCCTGACCAACTTTCCGCCTTTGCTGATTACGACAAGATTTTGTCTGTGGGCGTGATTGATGGTCGTAACATTTGGCGTGCGAACCTGAACCAAGTGTTGGATGTGGTGGAACCGTTAAAAGCGAAACTGGGCGATCGTTTGTGGATTGCGCCAAGCTGTTCTCTGCTTCACACCCCTTATGATTTATCGGTGGAAACACAGTTACAAGTAAAC > 1/1772794‑1773278 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |