| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,731,720 | G→A | intergenic (+360/‑48) | unknown → / → unknown | DNA topoisomerase IV subunit B (EC 5.99.1.3)/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,731,720 | 0 | G | A | 100.0% | 225.1 / NA | 79 | intergenic (+360/‑48) | unknown/unknown | DNA topoisomerase IV subunit B (EC 5.99.1.3)/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (43/36); total (43/36) | |||||||||||
CCCTGCTTTCCCTTGTTTCCCTTGTTCCACTGAATTTGCTTTACGGAAATTTTCGAACTCGCCACTACGTGATTCAAACAAAGCGAAAATTTCCTACAAATTCAACTCCACAAGGGCGGCAAAGAAGGGAACCCAATAAATAGCTCTAAAAGTGCGGTCGATTTTAAAATCATTTTTTAAATAAAAAAACATCCGAAAAAAATCAACTGCACTTTTCAGAATAACGCTCGAAATAATGGGTCCCCGTATAAATTGCCCGAACGTGCGTTAATTTTTAGGAAAATTTTGCTTTGTTTGAACCACGTAGTGGCGAGTTC‑AAAATTTTCCGTGAAGAAAATTAATGCTAAGAGAGGAAAAGCAATTTATCCGGGGTCGCCTTTCTTTTGGTTACTTTTCTTTGGCGAAGCAAAGAAAAGTAACTCGCCCCATCAGGCGAAACCGATTAACACAACCAAAATATGAACTACAAATGACAACAGAAT > 1/1731483‑1731964 | cccTGCTTTCCCTTGTTTCCCTTGTTCCACTGAATTTGCTTTACGGAAATTTTCGAACTCGCCACTACGTGATTCAAACAAAGCGAAAATTTCCTACAAATTCAACTCCACAAGGGCGGCAAAGAAGGGAACCCAATAAATAGCTCTAAAAGTGCGGTCGATTTTAAAATCATTTTTTAAATAAAAAAACATCCGAAAAAAATCAACTGCACTTTTCAGAATAACGCTCGAAATAATAGGTCCCCGTATaa < 1:526789/251‑1 (MQ=255) 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CCCTGCTTTCCCTTGTTTCCCTTGTTCCACTGAATTTGCTTTACGGAAATTTTCGAACTCGCCACTACGTGATTCAAACAAAGCGAAAATTTCCTACAAATTCAACTCCACAAGGGCGGCAAAGAAGGGAACCCAATAAATAGCTCTAAAAGTGCGGTCGATTTTAAAATCATTTTTTAAATAAAAAAACATCCGAAAAAAATCAACTGCACTTTTCAGAATAACGCTCGAAATAATGGGTCCCCGTATAAATTGCCCGAACGTGCGTTAATTTTTAGGAAAATTTTGCTTTGTTTGAACCACGTAGTGGCGAGTTC‑AAAATTTTCCGTGAAGAAAATTAATGCTAAGAGAGGAAAAGCAATTTATCCGGGGTCGCCTTTCTTTTGGTTACTTTTCTTTGGCGAAGCAAAGAAAAGTAACTCGCCCCATCAGGCGAAACCGATTAACACAACCAAAATATGAACTACAAATGACAACAGAAT > 1/1731483‑1731964 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |