| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,667,962 | G→A | intergenic (‑50/+522) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,667,962 | 0 | G | A | 100.0% | 194.8 / NA | 72 | intergenic (‑50/+522) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (31/41); total (31/41) | |||||||||||
ATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGGTATGTATAACCTGAAAAGGTTACAAAAGTTGGCGGAATGGACGGGACTCGAACCCGCGACCCCCTGCGTGACAGGCAGGTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCAC‑ACTGCCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTA > 1/1667716‑1668191 | aTGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGGTATGTATAACCTGAAAAGGTTACAAAAGTTGGCGGAATGGACGGGACTCGAACCCGCGACCCCCTGCGTGACAGGCAGGTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCAC‑ACTACCa < 1:289596/250‑1 (MQ=255) 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aTTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTc < 1:260900/251‑1 (MQ=21) aGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTg < 1:871901/96‑1 (MQ=255) aGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAgg > 1:175392/1‑251 (MQ=18) gTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCgg < 1:468053/167‑1 (MQ=17) 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aCTCTCACATAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCg > 1:676087/1‑251 (MQ=14) ctcACATAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGAt > 1:482805/1‑179 (MQ=17) ctcACATAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCAc > 1:673063/1‑213 (MQ=14) cacaTAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTg > 1:522200/1‑80 (MQ=255) cacaTAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAAt < 1:584003/148‑1 (MQ=17) cacaTAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTAc < 1:21967/189‑1 (MQ=17) cacaTAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACgg < 1:757444/203‑1 (MQ=14) cacaTAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGc > 1:570757/1‑247 (MQ=14) cacaTAGGGATGCCCCAC‑ACTACCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTa > 1:490783/1‑251 (MQ=14) | ATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGGTATGTATAACCTGAAAAGGTTACAAAAGTTGGCGGAATGGACGGGACTCGAACCCGCGACCCCCTGCGTGACAGGCAGGTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCAC‑ACTGCCATTGGCGTAAC‑AGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTA > 1/1667716‑1668191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |