| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,638,999 | A→C | *79E (TAA→GAA) | unknown ← | TRAP‑type C4‑dicarboxylate transport system, periplasmic component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,638,999 | 0 | A | C | 100.0% | 251.8 / NA | 81 | *79E (TAA→GAA) | unknown | TRAP‑type C4‑dicarboxylate transport system, periplasmic component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (38/43); total (38/43) | |||||||||||
CTTACCCGCATAGAAACTACGCGCACCACCATCATAATAAGTCAACCCAATGAAACCTTTGCCCTTTGATGAATCAAGAATTTTTTGCCCAACTTCAGGATCAAGTAGAGCACGATAATAATGATCAACATTATGGAAAAGATACGGAATATTGTATGCACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTGGTGACCCGGATTGCAATAATTACATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGTTTTGTCATTATTATGACTTAATTTTAGTACGGTTTTAGCAGAAGCTGAGAACGCCATCCCAGCTGATAACGCCAAGACCAATGCATAAGAAAAAACATTTTTTTTGATTTGCATAACGC > 1/1638763‑1639238 | cTTACCCGCATAGAAACTACGCGCACCACCATCATAATAAGTCAACCCAATGAAACCTTTGCCCTTTGATGAATCAAGAATTTTTTGCCCAACTTCAGGATCAAGTAGAGCACGATAATAATGATCAACATTATGGAAAAGATACGGAATATTGTATGCACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCt < 1:56996/251‑1 (MQ=255) 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atTGTATGCACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCatatat > 1:649327/1‑181 (MQ=255) ttGTATGCACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCatatat > 1:901757/1‑180 (MQ=255) aTGCACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTg < 1:779248/87‑1 (MQ=255) cACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGTTTTGTCATTATTATGACTTAATTTTAGTACGGTTTTAGCAGAAGCTGAGaa < 1:305871/250‑1 (MQ=255) 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ccATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCAt < 1:644176/176‑1 (MQ=255) ccATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGcac < 1:329068/188‑1 (MQ=255) ccATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGcac > 1:793640/1‑188 (MQ=255) ccATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGtt < 1:350634/198‑1 (MQ=255) ccATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTAGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGTTTTGTCATTATTATGACTTAATTTTAGTACGGTTTTAGCAGAAGCTGAGAACg > 1:409295/1‑250 (MQ=255) gCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCatatat < 1:322239/161‑1 (MQ=255) tGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGtt > 1:877094/1‑154 (MQ=255) tatCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCatatat > 1:553928/1‑122 (MQ=255) gATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGTTTTGTCATTATTATGACTTAATTTTAGTACGGTTTTAGCAGAAGCTGAGAACGCCATCCCAGCTGATAACGCCAAGACCAATGCATAAGAAAAAACATTTTTTTTGATTTGCATaa > 1:7932/1‑250 (MQ=255) ttGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGTTTTGTCATTATTATGACTTAATTTTAGTACGGTTTTAGCAGAAGCTGAGAACGCCATCCCAGCTGATAACGCCAAGACCAATGCATAAGAAAAAACATTTTTTTTGATTTGCATAACGc < 1:357457/251‑1 (MQ=255) gCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGTTTTGTCATTATTATGACTTAATTTTAGTACGGTTTTAGCAGAAGCTGAGAACGCCATCCCAGCTGATAAc > 1:832792/1‑200 (MQ=255) | CTTACCCGCATAGAAACTACGCGCACCACCATCATAATAAGTCAACCCAATGAAACCTTTGCCCTTTGATGAATCAAGAATTTTTTGCCCAACTTCAGGATCAAGTAGAGCACGATAATAATGATCAACATTATGGAAAAGATACGGAATATTGTATGCACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTGGTGACCCGGATTGCAATAATTACATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGTTTTGTCATTATTATGACTTAATTTTAGTACGGTTTTAGCAGAAGCTGAGAACGCCATCCCAGCTGATAACGCCAAGACCAATGCATAAGAAAAAACATTTTTTTTGATTTGCATAACGC > 1/1638763‑1639238 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |