| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,636,826 | T→G | L135L (CTA→CTC) | unknown ← | D‑mannonate oxidoreductase (EC 1.1.1.57) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,636,826 | 0 | T | G | 100.0% | 129.1 / NA | 43 | L135L (CTA→CTC) | unknown | D‑mannonate oxidoreductase (EC 1.1.1.57) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (27/16); total (27/16) | |||||||||||
CACGATTTTGGTTACTGACTAAAAAGCCAGGTGCAATGGCATTACAACGAAGACCTACTTTAGAAAAGTAAACGGCAAGCCATTGCGTGAAGTTACTAATTGCAGCTTTAGCACCGGAATAAGCTGCAATTTTTGTTAGTGGTGTAAAGGCATTCATACTTGAAATATTGATGATATTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTTAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAACACATTTGTTTTATAGGCTTTTGCACGACCGCCCGCTTGATTAAT > 1/1636582‑1637068 | cACGATTTTGGTTACTGACTAAAAAGCCAGGTGCAATGGCATTACAACGAAGACCTACTTTAGAAAAGTAAACGGCAAGCCATTGCGTGAAGTTACTAATTGCAGCTTTAGCACCGGAATAAGCTGCAATTTTTGTTAGTGGTGTAAAGGCATTCATACTTGAAATATTGATGATATTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGAtt < 1:596448/250‑1 (MQ=255) cGATTTTGGTTACTGACTAAAAAGCCAGGTGCAATGGCATTACAACGAAGACCTACTTTAGAAAAGTAAACGGCAAGCCATTGCGTGAAGTTACTAATTGCAGCTTTAGCACCGGAATAAGCTGCAATTTTTGTTAGTGGTGTAAAGGCATTCATACTTGAAATATTGATGATATTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTaaa > 1:713045/1‑251 (MQ=255) aTTTTGGTTACTGACTAAAAAGCCAGGTGCAATGGCATTACAACGAAGACCTACTTTAGAAAAGTAAACGGCAAGCCATTGCGTGAAGTTACTAATTGCAGCTTTAGCACCGGAATAAGCTGCAATTTTTGTTAGTGGTGTAAAGGCATTCATACTTGAAATATTGATGATATTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATa > 1:891354/1‑251 (MQ=255) gTGCAATGGCATTACAACGAAGACCTACTTTAGAAAAGTAAACGGCAAGCCATTGCGTGAAGTTACTAATTGCAGCTTTAGCACCGGAATAAGCTGCAATTTTTGTTAGTGGTGTAAAGGCATTCATACTTGAAATATTGATGATATTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTaaa > 1:860731/1‑251 (MQ=255) 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gtgtAAAGGCATTCATACTTGAAATATTGATGATATTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGAtt < 1:226488/109‑1 (MQ=255) gtgtAAAGGCATTCATACTTGAAATATTGATGATATTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCAcc > 1:852232/1‑226 (MQ=255) ggCATTCATACTTGAAATATTGATGATATTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGatta < 1:874765/205‑1 (MQ=255) tatTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAg > 1:411241/1‑213 (MQ=255) tatTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTCTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTa > 1:48506/1‑251 (MQ=255) ccTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGttt < 1:301257/121‑1 (MQ=255) ccTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGAt > 1:261898/1‑229 (MQ=255) aTCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGAtt > 1:153416/1‑56 (MQ=255) aTCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAacac < 1:312376/251‑1 (MQ=255) aaaaCCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAACACATTTGTTTTATAGGc < 1:89470/251‑1 (MQ=255) aaCCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAACACATTTGTTTTATAg < 1:109887/247‑1 (MQ=255) aaCCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAACACATTTGTTTTATAGGCtt > 1:746095/1‑251 (MQ=255) gtgtAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGcc > 1:7376/1‑52 (MQ=255) ggTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATg < 1:776569/159‑1 (MQ=255) ggTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAatat < 1:41781/208‑1 (MQ=255) ggTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAaca > 1:601411/1‑223 (MQ=255) ggTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAACACATTTGTTTTATAGGCTTTTGCACGAc > 1:571418/1‑250 (MQ=255) ggTAATAATGTACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAACACATTTGTTTTATAGGCTTTTGCACGAc > 1:893241/1‑250 (MQ=255) tACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAatat > 1:807349/1‑198 (MQ=255) tACCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAACACATTTGTTTTATAGGCTTTTGCACGAc > 1:548796/1‑240 (MQ=255) aCCTAAATAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAat < 1:499518/195‑1 (MQ=255) aaaTAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAg > 1:45282/1‑151 (MQ=255) aaaTAGTTGAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAACACATTTGTTTTATAGGCTTTTGCACGACCGCCCGCTTGATTAAt > 1:276667/1‑251 (MQ=255) | CACGATTTTGGTTACTGACTAAAAAGCCAGGTGCAATGGCATTACAACGAAGACCTACTTTAGAAAAGTAAACGGCAAGCCATTGCGTGAAGTTACTAATTGCAGCTTTAGCACCGGAATAAGCTGCAATTTTTGTTAGTGGTGTAAAGGCATTCATACTTGAAATATTGATGATATTTGCACCTTTTTTACCAATCATATCTTTCGCAAAAACCTGTGTAGGTAATAATGTACCTAAATAGTTTAGATTAAATACAAATTCAATGCCTGACTTATCTAAATCAAAGAACGTTTTTGTTGTTTCATTCAAGTCAAATTGATGAAATTCATTATCGGTAGTCGCTTTTGGATTATTACCACCGGCACCATTAATTAAAATGTCACAAGTGCCGAAATCGGCTTCAATTTGATTTCTGACTTCTTTAATATTTTCAAGTTCTAACACATTTGTTTTATAGGCTTTTGCACGACCGCCCGCTTGATTAAT > 1/1636582‑1637068 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |