| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,634,127 | A→G | *313W (TAG→TGG) | unknown → | ABC transporter, substrate‑binding protein (cluster 8, B12/iron complex) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,634,127 | 0 | A | G | 100.0% | 235.4 / NA | 78 | *313W (TAG→TGG) | unknown | ABC transporter, substrate‑binding protein (cluster 8, B12/iron complex) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (36/42); total (36/42) | |||||||||||
GGCATATAATGTGGCGGCGGAAAGCGTAAAAGGCTTTCAAACGGTTTCTATGGAAGAAGTTTTAAAATGGAATCCTGCCGTTATTTTGGTGCAGGATCGTTATCCGAAAGTGGTGGATGACATTGTAAACGACAACGTGTGGGAGACCATTGAGGCAGTAAAAAATCATCGCGTATTGTTAATGCCCGAATATGCCAAAGCCTGGGGCTATCCGATGCCTGAAGCGATTGCGTTGGGCGAAGTATAGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAAATAATAGCGCGTTATAAAAACGCAACGAAAAACCACCGCACTTTAACATTGATGTTGAAGTGCGGTTGAGTTTATTGATTAATTCATGATTAAGTGTTGATCCATTCCGCCACCTCTTTGGTTAACCGACCGATTTC > 1/1633882‑1634369 | ggCATATAATGTGGCGGCGGAAAGCGTAAAAGGCTTTCAAACGGTTTCTATGGAAGAAGTTTTAAAATGGAATCCTGCCGTTATTTTGGTGCAGGATCGTTATCCGAAAGTGGTGGATGACATTGTAAACGACAACGTGTGGGAGACCATTGAGGCAGTAAAAAATCATCGCGTATTGTTAATGCCCGAATATGCCAAAGCCTGGGGCTATCCGATGCCTGAAGCGATTGCGTTGGGCGAAGTATGGCTTg > 1:636984/1‑251 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1:59789/154‑1 (MQ=255) gggCTATCCGATGCCTGAAGCGATTGCGTTGGGCGAAGTATGGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAAATAATAGCGCGTTATAAAAACGCAACGAAAAACTACCGCACTTTAACAt > 1:66178/1‑196 (MQ=255) gggCTATCCGATGCCTGAAGCGATTGCGTTGGGCGAAGTATGGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAAATAATAGCGCGTTATAAAAACGCAACGAAAAACTACCGCACTTTAACATTGATGTTGAAGTGCGGTTGAGTTTAtt < 1:800909/223‑1 (MQ=255) ggCTATCCGATGCCTGAAGCGATTGCGTTGGGCGAAGTATGGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAAATAATAGCGCGTTATAAAAACGCAACGAAAAACTACCGCACTTTAACATTGATGTTGAAGTGCGGTTGAGTTTATTGATTAATTCATGATTAAgtgt > 1:597299/1‑243 (MQ=255) 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cGATTGCGTTGGGCGAAGTATGGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAAATAATAGCGCGTTATAAAAACGCAACGAAAAACTACCGCACTTTAACATTGATGTTGAAGTGCGGTTGAGTTTATTGATTAATTCATGATTAAGTGTTGATCCATTCCGCCACCTCTTTGGTTa > 1:257044/1‑251 (MQ=255) tGCGTTGGGCGAAGTATGGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAAATAATAGCGCGTTATAAAAACGCAACGAAAAACTACCGCACTTTAACATTGATGTTGAAGTGCGGTTGAGTTTATTGATTAATTCATGATTAAGTGTTGATCCATTCCGCCACCTCTTTGGTTAaccg < 1:363952/251‑1 (MQ=255) gTTGGGCGAAGTATGGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAAATAATAGCGCGTTATAAAAACGCAACGCAAAACTACCGCACTTTAAc < 1:189686/167‑1 (MQ=255) aaGTATGGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAaat < 1:67424/114‑1 (MQ=255) 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aGTATGGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAAATAATAGCGCGTTATAAAAACGCAACGAAAAACTACCGCACTTTAACATTGATGTTGAAGTGCGGTTGAGTTTATTGATTAATTCATGATTAAgtgt < 1:293465/208‑1 (MQ=255) | GGCATATAATGTGGCGGCGGAAAGCGTAAAAGGCTTTCAAACGGTTTCTATGGAAGAAGTTTTAAAATGGAATCCTGCCGTTATTTTGGTGCAGGATCGTTATCCGAAAGTGGTGGATGACATTGTAAACGACAACGTGTGGGAGACCATTGAGGCAGTAAAAAATCATCGCGTATTGTTAATGCCCGAATATGCCAAAGCCTGGGGCTATCCGATGCCTGAAGCGATTGCGTTGGGCGAAGTATAGCTTGCCAAAGAACTTTACCCGGCGCTTTTTCGCGATGTGGATTTAGATAAAATGGTTAACGACTATTATTTGAAATTCTATCGCCAGCCTTATAAAGCAGCAAAATAATAGCGCGTTATAAAAACGCAACGAAAAACCACCGCACTTTAACATTGATGTTGAAGTGCGGTTGAGTTTATTGATTAATTCATGATTAAGTGTTGATCCATTCCGCCACCTCTTTGGTTAACCGACCGATTTC > 1/1633882‑1634369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |