| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,619,502 | A→G | intergenic (‑59/‑80) | unknown ← / → unknown | Nicotinamide phosphoribosyltransferase (EC 2.4.2.12)/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,619,502 | 0 | A | G | 100.0% | 75.1 / NA | 26 | intergenic (‑59/‑80) | unknown/unknown | Nicotinamide phosphoribosyltransferase (EC 2.4.2.12)/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (12/14); total (12/14) | |||||||||||
CCGGTTTAGTTAGGTATTCCTTGAGAAAGGCCTGCAATCCGAAGAAAACAACATCAAACTCACTTTTACGGGCTTCGATATAAAAAGAGACATATTCGCTATCAGGCGGATATTGCAGCCAATGAGATGCTTTATAACTATCTGTATTTAGAATTAAATTCGTTAGATTTGAAGTATACATTTTACACCTATAAAAATAATACATACATAACCACTCGAATTGTAGCATATACTTTTCAATATTAACGCCATCTTTCAAAATTTAATACGCTAATCTCTCCCAATAACATTCAATTCATTAATTTTATTTAGAAACATATTGACAATAAAAGTAAATTTCGGTATTTCTAAGCACATTCTTTTTTCACACAAAAACACCATGAAAAACAACCGCACTTTTATTATGATGCCAACCACCATGACCATGATTATGATCAATGGGGCGGGCTAGTGCGTTGAAGAAT > 1/1619263‑1619726 | ccGGTTTAGTTAGGTATTCCTTGAGAAAGGCCTGCAATCCGAAGAAAACAACATCAAACTCACTTTTACGGGCTTCGATATAAAAAGAGACATATTCGCTATCAGGCGGATATTGCAGCCAATGAGATGCTTTATAACTATCTGTATTTAGAATTAAATTCGTTAGATTTGAAGTATACATTTTACACCTATAAAAATAATACATACATAACCACTCGAATTGTAGCATATACTTTTCAGTATTAACGCCa > 1:400660/1‑251 (MQ=255) 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CCGGTTTAGTTAGGTATTCCTTGAGAAAGGCCTGCAATCCGAAGAAAACAACATCAAACTCACTTTTACGGGCTTCGATATAAAAAGAGACATATTCGCTATCAGGCGGATATTGCAGCCAATGAGATGCTTTATAACTATCTGTATTTAGAATTAAATTCGTTAGATTTGAAGTATACATTTTACACCTATAAAAATAATACATACATAACCACTCGAATTGTAGCATATACTTTTCAATATTAACGCCATCTTTCAAAATTTAATACGCTAATCTCTCCCAATAACATTCAATTCATTAATTTTATTTAGAAACATATTGACAATAAAAGTAAATTTCGGTATTTCTAAGCACATTCTTTTTTCACACAAAAACACCATGAAAAACAACCGCACTTTTATTATGATGCCAACCACCATGACCATGATTATGATCAATGGGGCGGGCTAGTGCGTTGAAGAAT > 1/1619263‑1619726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |