| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,618,046 | T→C | H6R (CAT→CGT) | unknown ← | Pyridoxal phosphate‑containing protein YggS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,618,046 | 0 | T | C | 98.8% | 232.7 / ‑5.0 | 82 | H6R (CAT→CGT) | unknown | Pyridoxal phosphate‑containing protein YggS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (27/54); total (28/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.41e-01 | |||||||||||
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< 1:725741/176‑1 (MQ=255) ctcctGTACATAATTTTCTCCGAATGCCTCCTGTCCCGCTTCATACGCTGTTAAAATATCTTCAACGGGCTTGGTTTTAGAAACAGCCAGTAAAGTAACCGCACTTGGTGAGGACCCAATCATATGGCAGATTTGGGTTATTTTTTGCTGAACCAGCTGTAAATTACGTCGAATATTATCCATTGGTACGCCGCCTGATTTGTTCAAGTGTTTCAATATGTAATAGTTTTCCATTTAAATacac > 1:122287/1‑244 (MQ=255) ctcctGTACATAATTTTCTCCGAATGCCTCCTGTCCCGCTTCATACGCTGTTAAAATATCTTCAACGGGCTTGGTTTTAGAAACAGCCAGTAAAGTAACCGCACTTGGTGAGGACCCAATCATATGGCAGATTTGGGTTATTTTTTGCTGAACCAGCTGTAAATTACGTCGAATATTATCCATTGGTACGCCGCCTGATTTGTTCAAGTGTTTCAATATGTAATAGTTTTCCATTTAAATACACTGTACGc < 1:106793/251‑1 (MQ=255) cctGTACATAATTTTCTCCGAATGCCTCCTGTCCCGCTTCATACGCTGTTAAAATATCTTCAACGGGCTTGGTTTTAGAAACAGCCAGTAAAGTAACCGCACTTGGTGAGGACCCAATCATATGGCAGATTTGGGTTATTTTTTGCTGAACCAGCTGTAAATTACGTCGAATATTATCCATTGGTa < 1:328903/186‑1 (MQ=255) 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atGGCAGATTTGGGTTATTTTTTGCTGAACCAGCTGTAAATCACGTCGAATATTATCCATTGGTACGCCGCCTGATTTGTTCAAGTGTTTCAATATGTAATAGTTTTCCATTTAAATACACTGTACGCAATAGATTTTCTTGCTTATCCACTTCTTCTTCGCGCAAAGTTAGATATTCGCCATTTCTTCTGACTAAGGCAAGCCGTCCTTTTTTCGAACGTTTTTCCGCACCGGTAACGGGATCTTtatat < 1:661721/251‑1 (MQ=255) gCAGATTTGGGTTATTTTTTGCTGAACCAGCTGTAAATTACGTCGAATATTATCCATTGGTACGCCGCCTGATTTGTTCAAGTGTTTCAATATGTAATAGTTTTCCATTTAAATACACTGTACGCAATAGATTTTCTTGCTTATCCACTTCTTCTTCGCGCAAAGTTAGATATTCGCCATTTCTTCTGACTAAGGCAAGCCGTCCTTTTTTCGAACGTTTTTCCGCACCGGTAACGGGATCTTTATATAc < 1:559551/250‑1 (MQ=255) gCAGATTTGGGTTATTTTTTGCTGAACCAGCTGTAAATTACGTCGAATATTATCCATTGGTACGCCGCCTGATTTGTTCAAGTGTTTCAATATGTAATAGTTTTCCATTTAAATACACTGTACGCAATAGATTTTCTTGCTTATCCACTTCTTCTTCGCGCAAAGTTAGATATTCGCCATTTCTTCTGACTAAGGCAAGCCGTCCTTTTTTCGAACGTTTTTCCGCACCGGTAACGGGATCTTTATATAc < 1:418462/250‑1 (MQ=255) aTTTGGGTTATTTTTTGCTGAACCAGCTGTAAATTACGTCGAATATTATCCATTGGTACGCCGCCTGATTTGTTCAAGTGTTTCAATATGTAATAGTTTTCCATTTAAATACACTGTACGCAATAGATTTTCTTGCTTATCCACTTCTTCTTCGCGCAAAGTTAGATATTCGCCATTTCTTCTGACTAAGGCAAGCCGTCCTTTTTTCGAACGTTTTTCCGCACCGGTAACGGGATCTTTATATACATc < 1:3483/249‑1 (MQ=255) aTTTGGGTTATTTTTTGCTGAACCAGCTGTAAATTACGTCGAATATTATCCATTGGTACGCCGCCTGATTTGTTCAAGTGTTTCAATATGTAATAGTTTTCCATTTAAATACACTGTACGCAATAGATTTTCTTGCTTATCCACTTCTTCTTCGCGCAAAGTTAGATATTCGCCATTTCTTCTGACTAAGGCAAGCCGTCCTTTTTTCGAACGTTTTTCCGCACCGGTAACGGGATCTTTATATACATc < 1:747069/249‑1 (MQ=255) tATTTTTTGCTGAACCAGCTGTAAATTACGTCGAATATTATCCATTGGTACGCCGCCTGATTTGTTCAAGTGTTTCAATATGTAATAGTTTTCCATTTAAATACACTGTACGCAATAGATTTTCTTGCTTATCCACTTCTTCTTCGCGCAAAGTTAGATATTCGCCATTTCTTCTGACTAAGGCAAGCCGTCCTTTTTTCGAACGTTTTTCCGCACCGGTAACGGGATCTTTATATACATCACGCCATTTg < 1:896487/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |