| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,603,010 | T→C | A179A (GCT→GCC) | unknown → | DNA mismatch repair endonuclease MutH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,603,010 | 0 | T | C | 100.0% | 193.8 / NA | 67 | A179A (GCT→GCC) | unknown | DNA mismatch repair endonuclease MutH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (31/36); total (31/36) | |||||||||||
ACTGGCAAAATT‑CCCATGTCCGCCATAAATTATCCCGCGTTCTTTGGATTCCCATTGAAGGCAGCCGCCATATTCCGCTCGCGGAGCGACATATCGGAACACCGATTTTGTGGCAACCCAACGAGCGGCAAGAAGCTCTGTTAAAACAGGATTGGGAAGAGCTGATGGATTATATCGTGCTGGGTCAATTGGATAAAATTAATGCTCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCTGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGTTTGAATGGCTATTGAGTCCCGAGGCGCTAATCGCCTTATTCACCC > 1/1602769‑1603255 | accgggaaaaTTCCCCATGCCCGCCATAAATTATCCCGCGTTCTTTGGATTCCCATTGAAGGCAGCCGCCATATTCCGCTCGCGGAGCGACATATCGGAACACCGATTTTGTGGCAACCCAACGAGCGGCAAGAAGCTCTGTTAAAACAGGATTGGGAAGAGCTGATGGATTATATCGTGCTGGGTCAATTGGATAAAATTAATGCTCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAg < 1:78155/245‑1 (MQ=255)aCTGGCAAAATC‑CCCATGTCCGCCATAAATTATCCCGCGTTCTTTGGATTCCCATTGAAGGCAGCCGCCATATTCCGCTCGCGGAGCGACATATCGGAACACCGATTTTGTGGCAACCCAACGAGCGGCAAGAAGCTCTGTTAAAACAGGATTGGGAAGAGCTGATGGATTATATCGTGCTGGGTCAATTGGATAAAATTAATGCTCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGt < 1:693382/251‑1 (MQ=255) cAAAATC‑CCCATGTCCGCCATAAATTATCCCGCGTTCTTTGGATTCCCATTGAAGGCAGCCGCCATATTCCGCTCGCGGAGCGACATATCGGAACACCGATTTTGTGGCAACCCAACGAGCGGCAAGAAGCTCTGTTAAAACAGGATTGGGAAGAGCTGATGGATTATATCGTGCTGGGTCAATTGGATAAAATTAATGCTCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAgg < 1:468352/250‑1 (MQ=255) ttCCGCCATAAATTATCCCGCGTTCTTTGGATTCCCATTGAAGGCAGCCGCCATATTCCGCTCGCGGAGCGACATATCGGAACACCGATTTTGTGGCAACCCAACGAGCGGCAAGAAGCTCTGTTAAAACAGGATTGGGAAGAGCTGATGGATTATATCGTGCTGGGTCAATTGGATAAAATTAATGCTCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAgg < 1:50884/250‑1 (MQ=255) 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< 1:112923/251‑1 (MQ=255) tGGGAAGAGCTGATGGATTATATCGTGCTGGGTCAATTGGATAAAATTAATGCTCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTatat < 1:793052/251‑1 (MQ=255) aaGAGCTGATGGATTATATCGTGCTGGGTCAATTGGATAAAATTAATGCTCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGAt < 1:476153/250‑1 (MQ=255) aaGAGCTGATGGATTATATCGTGCTGGGTCAATTGGATAAAATTAATGCTCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGAt < 1:49377/250‑1 (MQ=255) 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tCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGTTTGAATGGCTATTg < 1:660022/251‑1 (MQ=255) cGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTAtt < 1:19882/112‑1 (MQ=255) cGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACt > 1:617191/1‑193 (MQ=255) cGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGt > 1:430696/1‑236 (MQ=255) cGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGTTTGAATGGCTATTGa > 1:156071/1‑251 (MQ=255) aGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATcg > 1:409723/1‑192 (MQ=255) aGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGTTTGAATGGCTATTGAGTCCCGAgg > 1:389028/1‑250 (MQ=255) aGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGTTTGAATGGCTATTGAGTCCCGAgg > 1:61630/1‑250 (MQ=255) gtgtTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTa < 1:752039/52‑1 (MQ=255) gtgtTACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGTTTGAATGGCTATTGAGTCCCGAGgcg > 1:392543/1‑250 (MQ=255) tACAGCTTCGCCCGAAAGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGTTTGAATGGCTATTGAGTCCCGAGGCGCTAAt < 1:420809/251‑1 (MQ=255) aaaGCCGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGTTTGAATGGCTATTGAGTCCCGAGGCGCTAATCGCCTTATTCAccc < 1:775207/251‑1 (MQ=255) | ACTGGCAAAATT‑CCCATGTCCGCCATAAATTATCCCGCGTTCTTTGGATTCCCATTGAAGGCAGCCGCCATATTCCGCTCGCGGAGCGACATATCGGAACACCGATTTTGTGGCAACCCAACGAGCGGCAAGAAGCTCTGTTAAAACAGGATTGGGAAGAGCTGATGGATTATATCGTGCTGGGTCAATTGGATAAAATTAATGCTCGTTTAGGCGAGGTGTTACAGCTTCGCCCGAAAGCTGCCAATAGTAAGGCGCTCACCAAAGGTATTGGTAAAAATGGCGAAATTATTGACACTCTCCCCCTCGGTTTTTATTTGCGCAAAGAGTTTACCTACCAAATTTTACAACAATTTGTGCAACAAGCTATTTAACCCTTTTCATTTATCTCTCAAAACTATATGATCGCGCACCTGTTTGTATTTTAAGGAAGCAATTATGTTTGAATGGCTATTGAGTCCCGAGGCGCTAATCGCCTTATTCACCC > 1/1602769‑1603255 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |