| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,577,284 | T→C | T5A (ACA→GCA) | unknown ← | Glutamate racemase (EC 5.1.1.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,577,284 | 0 | T | C | 100.0% | 226.5 / NA | 75 | T5A (ACA→GCA) | unknown | Glutamate racemase (EC 5.1.1.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (38/37); total (38/37) | |||||||||||
ACACAACGGTGCTTGCCGTATTACAGGCGATGACAATAAGATCCAACGGATACATTTGATCTATGCGTTGGCAGATTTTTAACGTACGTTCGATGATCTTTTCTTCAGGCTTCTCGGAATAAGGAAAGTAAGCGTTATCAAAGCAATACAAATAGTGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGTTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGATTAACCGCCTTTGTGGCGTTTGCTGAAATAGCCATTCGCCGATAGGTTTTTTGCCTAACATTGACAGTTCTTGG > 1/1577044‑1577519 | acacAACGGTGCTTGCCGTATTACAGGCGATGACAATAAGATCCAACGGATACATTTGATCTATGCGTTGGCAGATTTTTAACGTACGTTCGATGATCTTTTCTTCAGGCTTCTCGGAATAAGGAAAGTAAGCGTTATCAAAGCAATACAAATAGTGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTc > 1:566333/1‑250 (MQ=255) 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ccGTATTACAGGCGATGACAATAAGATCCAACGGATACATTTGATCTATGCGTTGGCAGATTTTTAACGTACGTTCGATGATCTTTTCTTCAGGCTTCTCGGAATAAGGAAAGTAAGCGTTATCAAAGCAATACAAATAGTGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGAt < 1:235011/250‑1 (MQ=255) ccGTATTACAGGCGATGACAATAAGATCCAACGGATACATTTGATCTATGCGTTGGCAGATTTTTAACGTACGTTCGATGATCTTTTCTTCAGGCTTCTCGGAATAAGGAAAGTAAGCGTTATCAAAGCAATACAAATAGTGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATg > 1:56239/1‑251 (MQ=255) ccGTATTACAGGCGATGACAATAAGATCCAACGGATACATTTGATCTATGCGTTGGCAGATTTTTAACGTACGTTCGATGATCTTTTCTTCAGGCTTCTCGGAATAAGGAAAGTAAGCGTTATCAAAGCAATACAAATAGTGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGATTGATg > 1:294661/1‑251 (MQ=255) 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1:891200/177‑1 (MQ=255) gTGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGttt > 1:638516/1‑187 (MQ=255) gTGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATaa < 1:741355/219‑1 (MQ=255) tGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGAtt < 1:599258/249‑1 (MQ=255) 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aCCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCGAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGATTAACCGCCTTTGTGGCGTTTGCTGaaa > 1:425147/1‑251 (MQ=255) aTGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTa < 1:444307/152‑1 (MQ=255) aTGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGAt > 1:821243/1‑219 (MQ=255) gATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGc < 1:640029/192‑1 (MQ=255) 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aaaaaaaGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGATTAACCGCCTTTGTGGCGTTTGCTGAAATAGCCATTCGCCGATAGGTTTTTTGCCTAACATTGACAg < 1:42610/251‑1 (MQ=255) gAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGCCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGATTAACCGCCTTTGTGGCGTTTGCTGAAATAGCCATTCGCCGATAGGTTTTTTGCCTAACATTGACAGTTCTTgg > 1:665580/1‑251 (MQ=255) gggTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTTACAt > 1:625848/1‑99 (MQ=255) | ACACAACGGTGCTTGCCGTATTACAGGCGATGACAATAAGATCCAACGGATACATTTGATCTATGCGTTGGCAGATTTTTAACGTACGTTCGATGATCTTTTCTTCAGGCTTCTCGGAATAAGGAAAGTAAGCGTTATCAAAGCAATACAAATAGTGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGTTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGATTAACCGCCTTTGTGGCGTTTGCTGAAATAGCCATTCGCCGATAGGTTTTTTGCCTAACATTGACAGTTCTTGG > 1/1577044‑1577519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |