| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,548,942 | A→G | G510G (GGT→GGC) | unknown ← | Exodeoxyribonuclease V beta chain (EC 3.1.11.5) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,548,942 | 0 | A | G | 100.0% | 157.2 / NA | 56 | G510G (GGT→GGC) | unknown | Exodeoxyribonuclease V beta chain (EC 3.1.11.5) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (27/29); total (27/29) | |||||||||||
CTTTACGGCTACGCACCAACACGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCACCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATGGGAGCGGTAATTTTTCGTTAAATTAAAACGATGTTGCGCTTGGCGGGTGGCTTGGAAATAAGTAAAAATGTCGGCGCCACGGAATTTATAAATCGCCTGTTTCGGGTCGCCAATCATAATAAAGCCGCTATCAGATTGAGCGTCTGTCTGAGGT > 1/1548713‑1549188 | cttTACGGCTACGCACCAACACGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATg > 1:390157/1‑251 (MQ=255)cttTACGGCTACGCACCAACACGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACACACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATg > 1:45623/1‑251 (MQ=255) tACGCACCAACACGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCATCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATag < 1:431234/251‑1 (MQ=255) tACGCACCAACACGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATag < 1:758628/251‑1 (MQ=255) tACGCACCAACACGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATag < 1:756962/251‑1 (MQ=255) tACGCACCAACACGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATag < 1:380314/251‑1 (MQ=255) cACCAACACGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGATTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGaa > 1:841080/1‑251 (MQ=255) cGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATag < 1:71248/239‑1 (MQ=255) aCTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAAcggcggatggtcg > 1:668516/1‑243 (MQ=255) ttGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTcac < 1:252476/251‑1 (MQ=255) tCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGACATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTcacac < 1:663107/250‑1 (MQ=255) tcaAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCcaccac < 1:132188/251‑1 (MQ=255) tcaAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCcaccac < 1:324951/251‑1 (MQ=255) gCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACgtgt < 1:239475/250‑1 (MQ=255) gCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACgtg < 1:413386/249‑1 (MQ=255) aaaaaCGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCCTAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAATCCACCACCTGTTGAt > 1:452231/1‑251 (MQ=255) gcgtcagatgtgtataagagacagcTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGCTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATg > 1:407014/25‑251 (MQ=255) aaCGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATggg < 1:773071/251‑1 (MQ=255) gTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACACAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAAACAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGGGGTGATgggggggggaat > 1:38357/1‑242 (MQ=255) ttttCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATGGGAGCGGTaa < 1:225336/249‑1 (MQ=255) tAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATGGGAGCGGTAATTTTTCGTTAAATTAAAAc < 1:359960/251‑1 (MQ=255) tAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATGGGAGCGGTAATTTTTCGTTAAATTAAAAc < 1:509773/251‑1 (MQ=255) atatTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAAACGATTCACACAGACCACCACGGGTTGGTGGGAGCGGGAATTTTTTGTTAAATTAAAAAGATGtt > 1:194664/1‑251 (MQ=255) ggATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTTGGTAAAATCAAAAAAACGATTCAAACAGGCCACCAAGGGTTGATGGGGGAGGGAATTTTTTGTTAAATTaaaaaggaggtgcg > 1:30885/1‑239 (MQ=255) ggATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTTATGGGAGCGGGAATTTTTCGTTAAATTAAAACGATGTTgcg > 1:753451/1‑249 (MQ=255) 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ggTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTTGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGGGTTGATGGGGGCGGTAATTTTTCGTTAAATTAAAACGATGTTGCGCTTGGCGGGGGGCTTGGGAATAAGTAAAAAAGTCGGCGCCCCGGGATTTATAAATCGCCTGTTTTGGGgcgc > 1:643083/1‑250 (MQ=255) ggTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATggg < 1:424873/142‑1 (MQ=255) cTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATGGGAGCGGTAATTTTTCGTTAAATTAAAACGATGTTGCGCTTGGCGGGTGGCTTGGAAATAAGTAAAAATGTCGGCGCCACGGAATTTATAAATCGCCTGTTTCGGGTCGCCAATCATAATAAAGc < 1:883449/250‑1 (MQ=255) aCCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCGCCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATGGGAGCGGGAATTTTTCGTTAAATTAAAACGATGTTGCGCTTGGCGGGGGGCTTGGGAATAAGTAAAAAAGTCGGCGCCACGGAATTTATAAATCGCCCGTTTTGGGTCGCCCATCATAATaaaacctggt > 1:194264/1‑244 (MQ=255) 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CTTTACGGCTACGCACCAACACGGCGATACTTTCCGGTTTCAGCGTTTTTTTGTCACCATCATCAAGGCGAAAAACGGCAGAGTTTTCCACCGCACTTTGTAGCCAATATTGGATAGAAACGGCGCAAGCTTTTGCCATGTTTTCTTTAACGGAGGCTTCATCCACATAAAAACGCACCGCAGGTTCCGGCTGCCCGCTTAACCAAAATTGCGGGTGATCCGTTCTTGCACCGACCGGCATAAATTGAATGTCTTTATAGAGAAACGGCGGTTGTTCGCTAAAATCAAACAACCGATTCACACAGTCCACCACGTGTTGATGGGAGCGGTAATTTTTCGTTAAATTAAAACGATGTTGCGCTTGGCGGGTGGCTTGGAAATAAGTAAAAATGTCGGCGCCACGGAATTTATAAATCGCCTGTTTCGGGTCGCCAATCATAATAAAGCCGCTATCAGATTGAGCGTCTGTCTGAGGT > 1/1548713‑1549188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |