| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,531,488 | T→G | intergenic (+25/+40) | unknown → / ← unknown | FIG002813: LPPG:FO 2‑phospho‑L‑lactate transferase like, CofD‑like/Putative DNA‑binding protein in cluster with Type I restriction‑modification system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,531,488 | 0 | T | G | 100.0% | 172.2 / NA | 57 | intergenic (+25/+40) | unknown/unknown | FIG002813: LPPG:FO 2‑phospho‑L‑lactate transferase like, CofD‑like/Putative DNA‑binding protein in cluster with Type I restriction‑modification system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (24/33); total (24/33) | |||||||||||
CACCATCGGCAAACCGATCATTGATGCCGCCATTGTTCCTTTTGACAACGCACCGGAAAATCTGCACGACATCAAAATCCTCGCCGGTCGCCTCAACGCCGACGACATCACCTACCGCCACGACCGCGCCCTCCTCTGCTCCGCCATTGACGAGCTATTGGGCGAACTGCTGGAATCGCACGACGACGAAGAACATTTGGAAGCCATTAATATCTAAAAAAGTGCGGTGAAAAAACACAAATAATTTTCACCGCACTTTTATTTATTCTAAAGTTTGAATGCTAGTTTTTTAGCAAAATAAAATGCTCAATCAACTTAATCATGAGTTCTTTCTGTTCAGGCAAACTTTCCGCCACAAGCAATGCTAATGCCACTAAAGTATTGTCATTAATCAATTGTTCTACCGGCCTTGCCAATAAGTGTTGATTCAACCGCAAATACCATAAAAACAGGAAAGATCCCGTGCGTTTATTGCCATCGGT > 1/1531247‑1531728 | cacCATCGGAAAACCGATCATTGATGCCGCCATTGTTCCTTTTGACAACGCCCCGGAAAATCTGCACGACATCAAAATCCTCGCCGGTCGCCTCAACGCCGACGACATCCCCTACCGCCACGACCGCGCCCTCCTCTGCTCCGCCATTGACGAGCTATTGGGCGAACTGCTGGAATCGCACGACGACGAAGAACATTTGGAAGCCATTAATATCTAAAAAAGTGCGGTGAAAAAACACAAAGAATTTTCAc < 1:240997/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |