| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,524,459 | C→T | E118K (GAA→AAA) | unknown ← | Transcriptional regulator/sugar kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,524,459 | 0 | C | T | 100.0% | 176.1 / NA | 61 | E118K (GAA→AAA) | unknown | Transcriptional regulator/sugar kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (28/33); total (28/33) | |||||||||||
CCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTCTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCACTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTAATGGATGCCGGCG > 1/1524213‑1524695 | ccAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTaaa < 1:553938/251‑1 (MQ=255) 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aCGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGa < 1:411646/251‑1 (MQ=255) aCGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGa < 1:49511/251‑1 (MQ=255) cTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGt > 1:496188/1‑251 (MQ=255) ttttACAAAAAATTTATCCATACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCGCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGGCGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTaa < 1:679526/251‑1 (MQ=255) ccAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTAATGGAt < 1:199008/251‑1 (MQ=255) tATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTAATGGATGCCGgcg > 1:616519/1‑249 (MQ=255) aGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAgg < 1:67407/141‑1 (MQ=255) | CCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTCTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCACTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTAATGGATGCCGGCG > 1/1524213‑1524695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |