| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 212,783 | C→G | A241P (GCA→CCA) | unknown ← | L‑threonate/D‑erythronate transcriptional regulator, DeoR family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 212,783 | 0 | C | G | 100.0% | 275.6 / NA | 90 | A241P (GCA→CCA) | unknown | L‑threonate/D‑erythronate transcriptional regulator, DeoR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (47/43); total (47/43) | |||||||||||
CGTATGCCCTTTTTGCCGCCCGAAACCGCGCACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTTTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGCTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAACCGACAGCTGACGTA > 1/212541‑213022 | cGTATGCCCTTTTTGCCGCCCGAAACCGCGCACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTg < 1:528350/251‑1 (MQ=255) aTGCCCTTTTTGCCGCCCGAAACCGCGCACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTAt < 1:272571/251‑1 (MQ=255) aTGCCCTTTTTGCCGCCCGAAACCGCGCACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTAt < 1:872522/251‑1 (MQ=255) cTTTTTGCCGCCCGAAACCGCGCACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGc < 1:591518/251‑1 (MQ=255) cgccCGAAACCGCGCACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTC‑AAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTc < 1:709782/251‑1 (MQ=255) cccGAAACCGCGCACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTc < 1:26172/250‑1 (MQ=255) cccGAAACCGCGCACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTc < 1:618923/250‑1 (MQ=255) cACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAaataa > 1:272648/1‑251 (MQ=255) ccTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAaataat > 1:827536/1‑250 (MQ=255) gTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATcac < 1:93957/238‑1 (MQ=255) tCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACg > 1:283468/1‑251 (MQ=255) gTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGc < 1:809847/207‑1 (MQ=255) tAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGc < 1:33971/250‑1 (MQ=255) ccAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCaa < 1:817597/250‑1 (MQ=255) cGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAgg < 1:873336/251‑1 (MQ=255) cacaTCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTa > 1:85623/1‑172 (MQ=255) cacaTCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGt > 1:336535/1‑251 (MQ=255) cacaTCGTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAACAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCg < 1:428074/250‑1 (MQ=255) gTCCAGTCTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGc > 1:147838/1‑172 (MQ=255) gTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTg > 1:444512/1‑150 (MQ=255) gTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTCTCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTgaga > 1:449690/1‑249 (MQ=255) gTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGAc < 1:767851/250‑1 (MQ=255) gTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGAc < 1:702821/250‑1 (MQ=255) taATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATc < 1:386521/251‑1 (MQ=255) cTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCtt < 1:95283/250‑1 (MQ=255) aTTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGc > 1:867165/1‑185 (MQ=255) ttttCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGa > 1:616779/1‑250 (MQ=255) cATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATc < 1:146380/147‑1 (MQ=255) ccTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAgg > 1:829226/1‑178 (MQ=255) ccTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGAc > 1:47464/1‑212 (MQ=255) ccTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGAc > 1:176562/1‑212 (MQ=255) ccTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGAc > 1:563939/1‑212 (MQ=255) cTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGAt < 1:373958/217‑1 (MQ=255) cTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGttttttt > 1:227433/1‑250 (MQ=255) cAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGc > 1:178319/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCttcatt > 1:522487/1‑251 (MQ=255) aaaaaTAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCttcattt < 1:747889/251‑1 (MQ=255) cACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCg > 1:166355/1‑164 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCtttt < 1:572886/81‑1 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTg < 1:299050/120‑1 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCtt > 1:657930/1‑129 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGCAGAGTCTGAGAc > 1:425736/1‑182 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAag > 1:359344/1‑172 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTc < 1:63108/206‑1 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGt > 1:321752/1‑251 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGt > 1:848397/1‑251 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGt > 1:864203/1‑251 (MQ=255) cTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGt > 1:104665/1‑251 (MQ=255) tGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTa < 1:466828/251‑1 (MQ=255) aaGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAg > 1:686905/1‑250 (MQ=255) gCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGAt > 1:508751/1‑181 (MQ=255) cTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGcc < 1:493546/249‑1 (MQ=255) cTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGcc < 1:203603/249‑1 (MQ=255) ataCCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGAc > 1:120613/1‑172 (MQ=255) ataCCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGt > 1:247038/1‑250 (MQ=255) taCCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGc < 1:549551/79‑1 (MQ=255) cccGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCaagaag < 1:663169/251‑1 (MQ=255) cGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAagag < 1:418506/251‑1 (MQ=255) gACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTg < 1:675214/56‑1 (MQ=255) aCATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATAGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAgg < 1:192089/250‑1 (MQ=255) tttGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTagag < 1:176395/251‑1 (MQ=255) ttGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAg < 1:637136/115‑1 (MQ=255) ttGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCttcatttc > 1:364699/1‑207 (MQ=255) gTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGt < 1:394655/214‑1 (MQ=255) aCCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAg > 1:416642/1‑250 (MQ=255) aCCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGc < 1:499031/251‑1 (MQ=255) aCCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGc < 1:135038/251‑1 (MQ=255) caacaaTTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACTCTTAATGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTTAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTAt > 1:153195/1‑168 (MQ=255) aaTTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAAc < 1:606668/251‑1 (MQ=255) aTTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTgaga > 1:130173/1‑132 (MQ=255) aTTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGAt < 1:574977/139‑1 (MQ=255) aTTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCttc < 1:662606/185‑1 (MQ=255) aTTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGcc > 1:844713/1‑208 (MQ=255) aTTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAAc > 1:671008/1‑250 (MQ=255) aTTCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAAc > 1:276789/1‑250 (MQ=255) ttCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAACCg > 1:545912/1‑251 (MQ=255) ttCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAACCg > 1:497035/1‑251 (MQ=255) tCAATATCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAACCGa > 1:130295/1‑251 (MQ=255) atCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTa < 1:392542/197‑1 (MQ=255) atCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGccc < 1:713757/202‑1 (MQ=255) atCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAg > 1:14983/1‑233 (MQ=255) atCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGc > 1:397476/1‑234 (MQ=255) atCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCaa < 1:827211/236‑1 (MQ=255) atCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAACCGACAg > 1:510426/1‑249 (MQ=255) tCCATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAACCGACAg > 1:320605/1‑248 (MQ=255) ccATATCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGtt > 1:360407/1‑194 (MQ=255) tatCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCAc < 1:796127/163‑1 (MQ=255) atCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGc > 1:727630/1‑72 (MQ=255) atCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGc > 1:560129/1‑228 (MQ=255) atCATGGATTGGTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAACCGACAGCTGACGTa > 1:728454/1‑251 (MQ=255) | CGTATGCCCTTTTTGCCGCCCGAAACCGCGCACCTCAGTCACCGTCATGCCGGTAATGCCAATGTCCGACAAGGCTTCACGCACATCGTCCAGTTTAAACGGTTTTATAATCGCTTCGATTTTTTTCATGATGATCGCTCCTTAAAAAATACTCAAAAAAATAACCGCACTTGTAAGCTATACCAACTTAGCCCCGACATTTTGTTATACCAGCAACAATTCAATATCCATATCATGGATTGCTTCTTTTGTATTAGGCAATAAATTCTTATCACAAATAATCGTATTGAAAACGCTTAAGGCTGCAATTTTGAAGGTGGCAACTTTGCCGTATTTTGAAGAGTCTGAGACTAAGATCCGCTTATTGCTTGACTCAATTATCGTTTTTTTCACCGGTAGCTTCATTTCATCCGGCGTAGTTAAGCCCGTCAATGTCCAAGAAGAGGTAGAGATAAAAGCAATGTCAACCGACAGCTGACGTA > 1/212541‑213022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |