| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,505,438 | A→G | V36A (GTA→GCA) | unknown ← | Outer membrane receptor for lactoferrin or transferrin, TonB‑dependent protein A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,505,438 | 0 | A | G | 100.0% | 215.7 / NA | 70 | V36A (GTA→GCA) | unknown | Outer membrane receptor for lactoferrin or transferrin, TonB‑dependent protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (37/33); total (37/33) | |||||||||||
CCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTACACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAACTTGCTCACGATTTATCGTTTCAGTTGTTTTTACAACTTTTCCTAATC > 1/1505201‑1505683 | cccTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCgg > 1:678380/1‑250 (MQ=255) cTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCAt > 1:527842/1‑251 (MQ=255) aaaCCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAAc < 1:290174/251‑1 (MQ=255) aaCCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAAcc < 1:666503/251‑1 (MQ=255) cATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTg < 1:206684/251‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTgcc < 1:267473/251‑1 (MQ=255) gTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACTTGTAc > 1:517554/1‑233 (MQ=255) cTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTgg < 1:564092/250‑1 (MQ=255) aTTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCAt > 1:542781/1‑226 (MQ=255) ggAATGTGTGGGAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACca > 1:714870/1‑251 (MQ=255) ggAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTAc > 1:212462/1‑212 (MQ=255) aaTGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACcac < 1:216742/250‑1 (MQ=255) gtgtgGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTAc > 1:798494/1‑207 (MQ=255) gtgtgGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTAc < 1:77201/207‑1 (MQ=255) gtgtgGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAAc > 1:499274/1‑244 (MQ=255) gCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAgac < 1:61664/246‑1 (MQ=255) gCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAAc < 1:167866/221‑1 (MQ=255) gCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGCAGACCAt > 1:446576/1‑250 (MQ=255) ggCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTac < 1:795717/249‑1 (MQ=255) gCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTacac < 1:661744/250‑1 (MQ=255) gCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTacac < 1:785045/250‑1 (MQ=255) gCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTacac < 1:23334/250‑1 (MQ=255) ttCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAgac > 1:628994/1‑222 (MQ=255) ttCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAgac > 1:807018/1‑222 (MQ=255) ttCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAgac < 1:615099/222‑1 (MQ=255) ttCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTaa > 1:874445/1‑251 (MQ=255) gTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTAc > 1:530844/1‑169 (MQ=255) aCCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTa < 1:180279/251‑1 (MQ=255) ccccAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGAc < 1:805199/190‑1 (MQ=255) cccAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGa < 1:122154/251‑1 (MQ=255) tttttACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATc < 1:325232/248‑1 (MQ=255) tttttACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATc < 1:830474/248‑1 (MQ=255) ttACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTacac < 1:94330/223‑1 (MQ=255) gggCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGaa > 1:241946/1‑251 (MQ=255) ggCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACg > 1:559165/1‑236 (MQ=255) ggATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAg > 1:860744/1‑186 (MQ=255) ggATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGaa > 1:477350/1‑251 (MQ=255) ggATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGaa > 1:229693/1‑251 (MQ=255) aTGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAgactgac < 1:557480/187‑1 (MQ=255) gTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTgcac < 1:609298/118‑1 (MQ=255) gTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGc > 1:851578/1‑250 (MQ=255) gTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGccc > 1:223345/1‑246 (MQ=255) tACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGAc < 1:813985/249‑1 (MQ=255) aaaCGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTg > 1:65911/1‑249 (MQ=255) gtaCCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGa > 1:743934/3‑251 (MQ=255) ggCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAgac < 1:605815/145‑1 (MQ=255) ggCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAg < 1:693750/143‑1 (MQ=255) ggCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTa < 1:857104/187‑1 (MQ=255) ggCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCt > 1:842406/1‑236 (MQ=255) ggCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAAtt > 1:723567/1‑250 (MQ=255) aTGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGa > 1:833562/1‑251 (MQ=255) cACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCa > 1:887430/1‑251 (MQ=255) ccATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTAc < 1:206427/88‑1 (MQ=255) cATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATAc < 1:384144/251‑1 (MQ=255) ttACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACgg > 1:570264/1‑251 (MQ=255) aCCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGAt > 1:228420/1‑242 (MQ=255) aCCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACggg > 1:723053/1‑250 (MQ=255) aCCATATTCTAAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGt > 1:313221/1‑251 (MQ=255) tCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATcc < 1:793248/251‑1 (MQ=255) cTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAag > 1:56676/1‑195 (MQ=255) gAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCcg > 1:766045/1‑165 (MQ=255) aCCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAAc < 1:113731/251‑1 (MQ=255) ccTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATc > 1:40675/1‑155 (MQ=255) tttCATTGGATTTTATGTTTTCATATCCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACTTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAACTTGCTCACGAt < 1:454278/251‑1 (MQ=255) gATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAAc < 1:50683/232‑1 (MQ=255) ttCATATTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGAc > 1:637939/1‑164 (MQ=255) atatTCAACTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAACTTGCTCACGATTTATCGTTTCAGTTGTTTTTa > 1:398344/1‑250 (MQ=255) cTTCGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAACTTGCTCACGATTTATCGTTTCAGTTGTTTTTACAACtttt > 1:767167/1‑250 (MQ=255) cGTTAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAACTTGCTCACGATTTATCGTTTCAGTTGTTTTTACAACTTTTcc < 1:201020/249‑1 (MQ=255) tAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAACTTGCTCACGATTTATCGTTTCAGTTGTTTTTACAACTTTTCCTAAt > 1:788541/1‑250 (MQ=255) tAATTGCACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAACTTGCTCACGATTTATCGTTTCAGTTGTTTTTACAACTTTTCCTAATc < 1:779434/251‑1 (MQ=255) | CCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTTTACCGGGCTGGATAATGTCATCCGCTGTTTTAGTACGAAACGCTACAGCACCGGCCAATGCACCATTACCATATTCTGAAGAACTGGAACCTTTACTGATTTCAATGGATTTTATGTTTTCATATTCAACTTCGTTAATTACACCTGTACCGGCATAACCGTTGCCGGCCGCCGGTGGACCTTGAACCACATAAGACTGACTTTGAGGTAGACCATCTACACTTAATGAAATTCTATTACGATCCATTCCGCGAATGGAATAACCGGAAGAGGTGCCCCGACCTTGCTCGACCACCGAAATTCCCGGATCATACGGGTTAAATCCCGAATATTTAAAACTTGCTCACGATTTATCGTTTCAGTTGTTTTTACAACTTTTCCTAATC > 1/1505201‑1505683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |