| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,488,358 | C→T | intergenic (‑43/+101) | unknown ← / ← unknown | Phenylalanyl‑tRNA synthetase alpha chain (EC 6.1.1.20)/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,488,358 | 0 | C | T | 100.0% | 196.2 / NA | 68 | intergenic (‑43/+101) | unknown/unknown | Phenylalanyl‑tRNA synthetase alpha chain (EC 6.1.1.20)/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (29/39); total (29/39) | |||||||||||
CTTGTTTGGCTTCGTTAATTTTTGCACCCACCGCCGGACGCTCTTCCGCCGCCACATTGCGTAGTTCTTGCATTAATTGGGTAAAATGCCCTTTTTTACC‑AAAATATTCCACCCGAATTTCATCAAGTGCCGCCAGGCTTTTATTTTCAATACTGTCTATAGCATTTCTTGCTTTCTCCACAAGATCTTTAAGATGCTGCATATATATCCTCTGTCATGTTCGATTTATCTAAAAAAATGCCTGCAATGATAATATTAACTGCTTAGAAAATCACGCAATTTATCACGTTTTACGCAAATTATTCGTGAGTAGAAAAGGATACCGATAAAAAACGCCCGAAAAAATTATTTACAAACTCGCTCTCTCGTTTCTTCACCCCTAACGGGCGGTTGGAAAAGCCAACGTTCAAAAAACGTTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTGTCCTGCAGGAAATTTTAGTGCTGAATCTATTAAGCTATTTTTCATAGACA > 1/1488114‑1488604 | cTTGTTTGGCTTCGTTAATTTTTGCACCCACCGCCGGACGCTCTTCCGCCGCCACATTGCGTAGTTCTTGCATTAATTGGGTAAAATGCCCTTTTTTACC‑AAAATATTCCACCCGAATTTCATCAAGTGCCGCCAGGCTTTTATTTTCAATACTGTCTATAGCATTTCTTGCTTTCTCCACAAGATCTTTAAGATGCTGCATATATATCCTCTGTCATGTTCGATTTATCTAAAAAAATGCCTGTAATGa < 1:818119/250‑1 (MQ=255) 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CTTGTTTGGCTTCGTTAATTTTTGCACCCACCGCCGGACGCTCTTCCGCCGCCACATTGCGTAGTTCTTGCATTAATTGGGTAAAATGCCCTTTTTTACC‑AAAATATTCCACCCGAATTTCATCAAGTGCCGCCAGGCTTTTATTTTCAATACTGTCTATAGCATTTCTTGCTTTCTCCACAAGATCTTTAAGATGCTGCATATATATCCTCTGTCATGTTCGATTTATCTAAAAAAATGCCTGCAATGATAATATTAACTGCTTAGAAAATCACGCAATTTATCACGTTTTACGCAAATTATTCGTGAGTAGAAAAGGATACCGATAAAAAACGCCCGAAAAAATTATTTACAAACTCGCTCTCTCGTTTCTTCACCCCTAACGGGCGGTTGGAAAAGCCAACGTTCAAAAAACGTTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTGTCCTGCAGGAAATTTTAGTGCTGAATCTATTAAGCTATTTTTCATAGACA > 1/1488114‑1488604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |