| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,482,246 | T→C | N286N (AAT→AAC) | unknown → | TonB‑dependent receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,482,246 | 0 | T | C | 100.0% | 240.6 / NA | 83 | N286N (AAT→AAC) | unknown | TonB‑dependent receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (42/41); total (42/41) | |||||||||||
ACCTGACATTGGGTGCCAACTACACTTATACCCGCGCAAAAAATAAAACCTACACGAACTTTATTGTGCGCGATATTCCGCAACATAAATTCTTCGCTTATGTGGATTGGAAAATTGTGCCTAACCTTTCCCTTTATGTCAGTCAAGAAGCGGAACACGGTCGTTATAGCAGAGATGGTTTCGGCAGCCGGGCGCCGACGGTTAGACTTTCCGGCTTCGGCAATACCAATGCCAAACTCACTTACAATGTTACCGAACAATTCATCGTGGAAGCCGGCGTATTCAACCTGTTTGATAAAAACTACTATTATGAAGCCGGTTATCCGGAAGCGGGACGAGTGTATTTTTCTAACTTGAAATATCGTTTTTAATATTCTGCTTAGCGATAAAAATTGAGCCTTGCAATGACAAAGCTCAATTTATTTTAAGGAATAAAGTGCGGTTGCTTTTCTCAGCGTTTTTAATCTGCTTTTAACGCATATT > 1/1481999‑1482481 | aCCTGACATTGGGTGCCAACTACACTTATACCCGCGCAAAAAATAAAACCTACACGAACTTTATTGTGCGCGATATTCCGCAACATAAATTCTTCGCTTATGTGGATTGGAAAATTGTGCCTAACCTTTCCCTTTATGTCAGTCAAGAAGCGGAACACGGTCGTTATAGCAGAGATGGTTTCGGCAGCCGGGCGCCGACGGTTAGACTTTCCGGCTTCGGCAATACCAATGCCAAACTCACTTACAACGtt > 1:568648/1‑251 (MQ=255) 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1:237402/251‑1 (MQ=255) cGGTTAGACTTTCCGGCTTCGGCAATACCAATGCCAAACTCACTTACAACGTTACCGAACAATTCATCGTGGAAGCCGGCGTATTCAACCTGTTTGATAAAAACTACTATTATGAAGCCGGTTATCCGGAAGCGGGACGAGTGTATTTTTCTAACTTGAAATATCGTTTTTAATATTc < 1:667669/178‑1 (MQ=255) ttCGGCAATACCAATGCCAAACTCACTTACAACGTTACCGAACAATTCATCGTGGAAGCCGGCGTATTCAACCTGTTTGATAAAAACTACTATTATGAAGCCGGTTATCCGGAAGCGGGACGAGTGTATTTTTCTAACTTGAAATATCGTTTTTAATATTCTGCTTAGCGATAAAAATTGAGCCTTGCAATGACAAAGCTCAATTTATTTTAAGGAATAAAGTGCGGTTGCTTTTCTCAGCGTTTTTAATc < 1:766096/251‑1 (MQ=255) ttCGGCAATACCAATGCCAAACTCACTTACAACGTTACCGAACAATTCATCGTGGAAGCCGGCGTATTCAACCTGTTTGATAAAAACTACTATTATGAAGCCGGTTATCCGGAAGCGGGACGAGTGTATTTTTCTAACTTGAAATATCGTTTTTAATATTCTGCTTAGCGATAAAAATTGAGCCTTGCAATGACAAAGCTCAATTTATTTTAAGGAATAAAGTGCGGTTGCTTTTCTCAGCGTTTTTAATc < 1:127666/251‑1 (MQ=255) 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ACCTGACATTGGGTGCCAACTACACTTATACCCGCGCAAAAAATAAAACCTACACGAACTTTATTGTGCGCGATATTCCGCAACATAAATTCTTCGCTTATGTGGATTGGAAAATTGTGCCTAACCTTTCCCTTTATGTCAGTCAAGAAGCGGAACACGGTCGTTATAGCAGAGATGGTTTCGGCAGCCGGGCGCCGACGGTTAGACTTTCCGGCTTCGGCAATACCAATGCCAAACTCACTTACAATGTTACCGAACAATTCATCGTGGAAGCCGGCGTATTCAACCTGTTTGATAAAAACTACTATTATGAAGCCGGTTATCCGGAAGCGGGACGAGTGTATTTTTCTAACTTGAAATATCGTTTTTAATATTCTGCTTAGCGATAAAAATTGAGCCTTGCAATGACAAAGCTCAATTTATTTTAAGGAATAAAGTGCGGTTGCTTTTCTCAGCGTTTTTAATCTGCTTTTAACGCATATT > 1/1481999‑1482481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |