| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,432,371 | G→A | A602T (GCG→ACG) | unknown → | Glycogen phosphorylase (EC 2.4.1.1) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,432,371 | 0 | G | A | 100.0% | 161.7 / NA | 57 | A602T (GCG→ACG) | unknown | Glycogen phosphorylase (EC 2.4.1.1) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (35/22); total (35/22) | |||||||||||
ACATTAAATTCGATAACAAAGTGCGTCTTGCCAATTACGTCAAAAAAGAATTGGGTATTGAACTTGACCCGCACGCCTTGTTTGATGTTCAGGTGAAACGTATTCACGAATATAAACGCCAAATTCTCAACGTGTTGCACATCATCGCACGTTACAACGAGATGTTGACGCACCCGGAAAAAGACTGGCAGCCGCGCGTCTTTATCTTAGCCGGTAAAGCCGCTTCCGCTTACTACGCGGCAAAACAAACTATTCATTTGATTAATGACGTTGCCAACGTGATTAATAACGATGTGCGTTTGCGCGGTCGCTTAAAAGTGGTATTCATTCCGAACTACAGCGTCAGTCTGGCGCAGTTAATCATTCCGGCGGCGGATATTTCCGAGCAAATTTCTCTGGCGGGTACGGAAGCCTCCGGTACCGGTAACATGAAGTTTGCCCTTAACGGCGCCTTAATATTAGGTACGTTGGACGGCGCAAACG > 1/1432135‑1432617 | aCATTAAATTCGATAACAAAGTGCGTCTTGCCAATTACGTCAAAAAAGAATTGGGTATTGAACTTGCCCCGCACGCCTTGTTTGATGTTCAGGTGAAACGTATTCACGAATATAAACGCCAAATTCTCAACGTGTTGCACATCATCGCACGTTACAACGAGATGTTGACGCACCCGGAAAAAGACTGGCAGCCGCGCGTCTTTATCTTAGCCGGTAAAGCCGCTTCCGCTTACTACACGGCAaaacaaac < 1:164380/250‑1 (MQ=255) aTAACAAAGTGCGTCTTGCCAATTACGTCAAAAAAGAATTGGGTATTGAACTTGACCCGCACGCCTTGTTTGATGTTCAGGTGAAACGTATTCACGAATATAAACGCCAAATTCTCAACGTGTTGCACATCATCGCACGTTACAACGAGATGTTGACGCACCCGGAAAAAGACTGGCAGCCGCGCGTCTTTATCTTAGCCGGTAAAGCCGCTTCCGCTTACTACACGGCAAAACAAACTATTCATTTGAtt < 1:34371/251‑1 (MQ=255) aaCAAAGTGCGTCTTGCCAATTACGTCAAAAAAGAATTGGGTATTGAACTTGACCCGCACGCCTTGTTTGATGTTCAGGTGAAACGTATTCACGAATATAAACGCCAAATTCTCAACGTGTTGCACATCATCGCACGTTACAACGAGATGTTGACGCACCCGGAAAAAGACTGGCAGCCGCGCGTCTTTATCTTAGCCGGTAAAGCCGCTTCCGCTTACTACACGGCAAAACAAACTATTCATTTGATTaa > 1:122540/1‑251 (MQ=255) aaGTGCGTCTTGCCAATTACGTCAAAAAAGAATTGGGTATTGAACTTGACCCGCACGCCTTGTTTGATGTTCAGGTGAAACGTATTCACGAATATAAACGCCAAATTCTCAACGTGTTGCACATCATCGCACGTTACAACGAGATGTTGACGCACCCGGAAAAAGACTGGCAGCCGCGCGTCTTTATCTTAGCCGGTAAAGCCGCTTCCGCTTACTACACGGCAAAACAAACTATTCATTTGATTAATGAc < 1:549237/251‑1 (MQ=255) 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ACATTAAATTCGATAACAAAGTGCGTCTTGCCAATTACGTCAAAAAAGAATTGGGTATTGAACTTGACCCGCACGCCTTGTTTGATGTTCAGGTGAAACGTATTCACGAATATAAACGCCAAATTCTCAACGTGTTGCACATCATCGCACGTTACAACGAGATGTTGACGCACCCGGAAAAAGACTGGCAGCCGCGCGTCTTTATCTTAGCCGGTAAAGCCGCTTCCGCTTACTACGCGGCAAAACAAACTATTCATTTGATTAATGACGTTGCCAACGTGATTAATAACGATGTGCGTTTGCGCGGTCGCTTAAAAGTGGTATTCATTCCGAACTACAGCGTCAGTCTGGCGCAGTTAATCATTCCGGCGGCGGATATTTCCGAGCAAATTTCTCTGGCGGGTACGGAAGCCTCCGGTACCGGTAACATGAAGTTTGCCCTTAACGGCGCCTTAATATTAGGTACGTTGGACGGCGCAAACG > 1/1432135‑1432617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |