| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,424,390 | T→C | Y375Y (TAT→TAC) | unknown → | 1,4‑alpha‑glucan (glycogen) branching enzyme, GH‑13‑type (EC 2.4.1.18) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,424,390 | 0 | T | C | 100.0% | 193.2 / NA | 63 | Y375Y (TAT→TAC) | unknown | 1,4‑alpha‑glucan (glycogen) branching enzyme, GH‑13‑type (EC 2.4.1.18) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (34/29); total (34/29) | |||||||||||
GTTCTTGGGGTTATCAACCGCTTGGCTTGTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTATAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGAAAACTTAGAAGCCATTGAATTTTTGAAACATACCAAC‑TGGAAAATCCATAGCGAAGTACCGGGTTCTATCGCCATTG > 1/1424152‑1424634 | gTTCTTGGGGTTATCAACCGCTTGGCTTGTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAAc < 1:41921/242‑1 (MQ=255)gTTCTTGGGGTTATCAACCGCTTGGCTTGTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACg > 1:719034/1‑250 (MQ=255)gTTCTTGGGGTTATCAACCGCTTGGCTTGTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACg > 1:548103/1‑250 (MQ=255) gggTTATCAACCGCTTGGCTTGTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAAc > 1:256823/1‑235 (MQ=255) gTTATCAACCGCTTGGCTTGTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTCCGGACGCAACGAAGtt > 1:864320/1‑251 (MQ=255) aaCCGCTTGGCTTGTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAAt < 1:568255/251‑1 (MQ=255) gTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTa > 1:314340/1‑251 (MQ=255) ccAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTAt < 1:491894/251‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTg < 1:313885/249‑1 (MQ=255) cGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCt < 1:102725/251‑1 (MQ=255) cGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCt < 1:397967/251‑1 (MQ=255) cGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCt < 1:500165/251‑1 (MQ=255) ttttGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGc > 1:628800/1‑205 (MQ=255) tGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTTCGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAAc < 1:257544/251‑1 (MQ=255) cTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGAc < 1:617424/250‑1 (MQ=255) cTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCggg > 1:284852/1‑251 (MQ=255) cTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCggg > 1:209720/1‑251 (MQ=255) tGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGt < 1:301509/210‑1 (MQ=255) tGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGt > 1:731640/1‑250 (MQ=255) gTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAAc < 1:220573/165‑1 (MQ=255) agCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGc < 1:384192/250‑1 (MQ=255) cATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGt > 1:841531/1‑250 (MQ=255) gCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGTTGCGGTGGCGTCTTTGAt > 1:582157/1‑251 (MQ=255) gTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGc > 1:272327/1‑232 (MQ=255) gTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGAt > 1:853042/1‑247 (MQ=255) tATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTAt < 1:505760/250‑1 (MQ=255) tATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTAt < 1:576001/250‑1 (MQ=255) aTTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCg > 1:631034/1‑251 (MQ=255) aaTGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGa > 1:294023/1‑251 (MQ=255) aTGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGAt > 1:803592/1‑251 (MQ=255) aTGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATATGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGGCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGAt > 1:887838/1‑251 (MQ=255) aTTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAAc < 1:622796/132‑1 (MQ=255) aTTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGc < 1:353417/173‑1 (MQ=255) tctcGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATcc < 1:515895/163‑1 (MQ=255) tGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGc > 1:355884/1‑208 (MQ=255) gCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAggg > 1:159714/1‑250 (MQ=255) ccGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGc < 1:485865/250‑1 (MQ=255) ccGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGc < 1:270370/250‑1 (MQ=255) ggCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCt > 1:683111/1‑166 (MQ=255) gCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTgg < 1:160441/250‑1 (MQ=255) tttCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTc < 1:582617/251‑1 (MQ=255) aGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATc < 1:559470/250‑1 (MQ=255) aGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCa > 1:146877/1‑251 (MQ=255) tACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAAc < 1:433815/155‑1 (MQ=255) tACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATAcg > 1:54067/1‑251 (MQ=255) gTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGt > 1:207633/1‑209 (MQ=255) gTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTc > 1:788440/1‑231 (MQ=255) aTTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGGGGGGAAAATTaa > 1:497679/1‑250 (MQ=255) gCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGt > 1:201121/1‑109 (MQ=255) gCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGAt < 1:379481/170‑1 (MQ=255) gCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGt < 1:56569/186‑1 (MQ=255) gCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGAAAACTTAGAAg < 1:627346/241‑1 (MQ=255) gTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGGGGGGAAACTTAGAAGCCATTGAAattttta > 1:323109/1‑249 (MQ=255) gTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTAACCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGAttt > 1:269787/1‑167 (MQ=255) cACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGGAAACTTAGAAGCCCTTGAAt > 1:636346/1‑238 (MQ=255) cGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGGGGGAAAACTTAGAAGGCATTGAATTTTTTAAACATACCa > 1:274535/1‑251 (MQ=255) gCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTAt < 1:375723/83‑1 (MQ=255) cACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGAAAACTTAGAAGCCATTGAATTTTTTAAACATACCAAC‑TGGAAAATCCATAGCGAAgg > 1:652329/1‑250 (MQ=255) aGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGGAAACTTAGAAGGCATTGAATTTTTTAAAAATACCAACTTGGAAAA‑CCATAACGAAGTACCgg > 1:691506/1‑251 (MQ=255) gATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGCAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGAGATTACAGGCGCGCCGAAGGGCAGTGGAATCCGAATCAATACGGCGGGCGGGAAAACTTAGAAGCCATTGaa < 1:83649/207‑1 (MQ=255) aCGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGGAAACTTAGAAGCCATTGAATTTTTTAAACATACCAAC‑TGGGAAAACCATAGCGAAggac > 1:198017/1‑235 (MQ=255) gATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTAt < 1:8724/58‑1 (MQ=255) gATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGGAAACTTAGAAGCCATTGAATTTTTGAAACATACCAAA‑TGGAAAAACCATAGCGAAGTACCGGGGTCTATCGCCAttt > 1:576307/1‑250 (MQ=255) | GTTCTTGGGGTTATCAACCGCTTGGCTTGTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTATAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGAAAACTTAGAAGCCATTGAATTTTTGAAACATACCAAC‑TGGAAAATCCATAGCGAAGTACCGGGTTCTATCGCCATTG > 1/1424152‑1424634 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |