| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,396,607 | G→C | L10F (TTG→TTC) | unknown → | PTS system, galactitol‑specific IIC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,396,607 | 0 | G | C | 100.0% | 130.7 / NA | 44 | L10F (TTG→TTC) | unknown | PTS system, galactitol‑specific IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (25/19); total (25/19) | |||||||||||
AATTATGTGAAGAAAACCATATTCCGCTGGAACTGGTACAATGCCGAATCAATGAAATCGACAGTTATATTCAAGATGTGGATTTGATTTGCACCACCTCGAAAATTACCCAAACCTACGGTGATATTCCGATTATACACGGCATGCCTTTTGTTTCCGGTGTCGGAATTGAACAGCTTAAAAAGAAAATCTTAACAATTTTAAGAGGATAATCATTATGTTTACGCAAATCATGCAGTACA‑TTTTGGATCTCGGGCCGTCGGTCATGCTGCCGATTGTGATTATTATTCTTTCGTTGTTGCTCGGCATGAAAGCCGGCGATTCCTTTAAGGCCGGATTACAAATCGGTATTGGCTTTGTAGGGATCGGGCTGGTTATCGGCTTAATGCTGGATTCTATCGGACCGGCAGCAAAAGCGATGGCGCAGGCATTTGATATTAATTTGAATGTGGTGGATATCGGCTGGCCGGGCGCCGCACCGATTACTTG > 1/1396361‑1396849 | aaTTATGTGAAGAAAACCATATTCCGCTGGAACTGGTACAATGCCGAATCAATGAAATCGACAGTTATATTCAAGATGTGGATTTGATTTGCACCACCTCGAAAATTACCCAAACCTACGGTGATATTCCGATTATACACGGCATGCCTTTTGTTTCCGGTGTCGGAATTGAACAGCTTAAAGAGAAAATCTTAACAATTTTAAGAGGATAATCATTATGTTTACGCAAATCATGCAGTACA‑TTTTCGAtc < 1:368170/251‑1 (MQ=255) 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tACA‑TTTTCGATCTCGGGCCGTCGGTCATGCTGCCGATTGTGATTATTATTCTTTCGTTGTTGCTCGGCATGAAAGCCGGCGATTCCTTTAAGGCCGGATTACAAATCGGTATTGGCTTTGTAGGGATCGGGCTGGTTATCGGCTTAATGCTGGATTCTATCGGACCGGCAGCAAAAGCGATGGTGCAGGCATTTGATATTAATTTGAATGTGGTGGATATCGGCTGGCCGGGCGCCGCACCGATTACTTg < 1:643425/251‑1 (MQ=255) | AATTATGTGAAGAAAACCATATTCCGCTGGAACTGGTACAATGCCGAATCAATGAAATCGACAGTTATATTCAAGATGTGGATTTGATTTGCACCACCTCGAAAATTACCCAAACCTACGGTGATATTCCGATTATACACGGCATGCCTTTTGTTTCCGGTGTCGGAATTGAACAGCTTAAAAAGAAAATCTTAACAATTTTAAGAGGATAATCATTATGTTTACGCAAATCATGCAGTACA‑TTTTGGATCTCGGGCCGTCGGTCATGCTGCCGATTGTGATTATTATTCTTTCGTTGTTGCTCGGCATGAAAGCCGGCGATTCCTTTAAGGCCGGATTACAAATCGGTATTGGCTTTGTAGGGATCGGGCTGGTTATCGGCTTAATGCTGGATTCTATCGGACCGGCAGCAAAAGCGATGGCGCAGGCATTTGATATTAATTTGAATGTGGTGGATATCGGCTGGCCGGGCGCCGCACCGATTACTTG > 1/1396361‑1396849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |