| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,393,775 | T→C | L65P (CTG→CCG) | unknown → | Tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase (EC 4.1.2.40) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,393,775 | 0 | T | C | 100.0% | 150.0 / NA | 51 | L65P (CTG→CCG) | unknown | Tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase (EC 4.1.2.40) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (34/17); total (34/17) | |||||||||||
ATTCAAAACATATCGAAAGTTTTAAGTGAATATCGAAAGTAGGAGAAAAAGATGACAATATTAAAACAAAAACGGTTGGAAAAATTATACGGTAAAGAGCGAATTTTTCGCGCTTTAGCAATTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCTGGAATTTGGCTGGCAGGCAGCGGGATTAAAAGAGCAGCATTGCGGTTTAATTATGGCTTACGAAAAAACCGGCTATGACAAAACCAAAATCGGACGTTTTCCCGATTTGATTGACGGCGTATCGGTTAAGGGGTTGAAAGAGAAAGGCGCAGATGCGGTGAAATTGCTGTTGTACTTTGATGTAGATGAGGGTGACGCGATTAATCGGGTGAAAACCGCTTTTGTAGAACGCGTCGGTTCCGAAT > 1/1393531‑1394020 | aTTCAAAACATATCGAAAGTTTTAAGTGAATATCGAAAGTAGGAGAAAAAGATGACAATATTAAAACAAAAACGGTTGGAAAAATTATACGGTAAAGAGCGAATTTTTCGCGCTTTAGCCATTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAAtt > 1:644008/1‑251 (MQ=255)aTTCAAAACATATCGAAAGTTTTAAGTGAATATCGAAAGTAGGAGAAAAAGATGACAATATTAAAACAAAAACGGTTGGAAAAATTATACGGTAAAGAGCGAATTTTTCGCGCTTTAGCCATTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAAtt > 1:830126/1‑251 (MQ=255) atCGAAAGTTTTAAGTGAATATCGAAAGTAGGAGAAAAAGATGACAATATTAAAACAAAAACGGTTGGAAAAATTATACGGTAAAGAGCGAATTTTTCGCGCTTTAGCCATTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAAttt < 1:124188/241‑1 (MQ=255) gTTTTAAGTGAATATCGAAAGTAGGAGAAAAAGATGACAATATTAAAACAAAAACGGTTGGAAAAATTATACGGTAAAGAGCGAATTTTTCGCGCTTTAGCCATTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAATTTGGCTGGCAGGCAGCggg > 1:758127/1‑251 (MQ=255) 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atatTAAAACAAAAACGGTTGGAAAAATTAGACGGTAAAGAGCGAATTTTTCGCGCTTTAGCCATTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTGTAAAAGGTTAGTGACCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAATTTGGCTGGCAGGCAGCGGGATTAAAAGAGCAGCATTGCgg < 1:829444/233‑1 (MQ=255) tatTAAAACAAAAACGGTTGGAAAAATTATACGGTAAAGAGCGAATTTTTCGCGCTTTAGCCATTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAATTTGGCTGGCAGGCAGCGGGATTAAAAGAGCAGCATTGCGGTTTAATTATGGCTTACGaa > 1:520109/1‑251 (MQ=255) tatTAAAACAAAAACGGTTGGAAAAATTATACGGTAAAGAGCGAATTTTTCGCGCTTTAGCCATTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAATTTGGCTGGCAGGCAGCGGGATTAAAAGAGCAGCATTGCGGTTTAATTATGGCTTACGaa > 1:667666/1‑251 (MQ=255) 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1:129625/1‑222 (MQ=255) aTTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAATTTGGCTGGCAGGCAGCGGGATTAAAAGAGCAGCATTGCGGTTTAATTATGGCTTACGAAAAAACCGGCTATGACAAAACCAAAATCGGACGTTTTCCCGATTTGATTGACGGCGTATCGGt > 1:811640/1‑251 (MQ=255) ttGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTTCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAATTTGGCTGGCAGGCAGCGGGATTAAAAGAGCAGCATTGCGGTTTAATTATGGCTTACGAAAAAACCGGCTATGACAAAACCAAAATCGGACGTTTTCCCGATTTGATTGACGGCGTATCGGtt < 1:430636/251‑1 (MQ=255) ttGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCCGGAATTTGGCTGGCAGGCAGCGGGATTAAAAGAGCAGCATTGCGGTTTAATTATGGCTTACGAAAAAACCGGCTATGACAAAACCAAAATCGGACGTTTTCCCGATTTGATTGACGGCGTATCGGtt < 1:515599/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) | ATTCAAAACATATCGAAAGTTTTAAGTGAATATCGAAAGTAGGAGAAAAAGATGACAATATTAAAACAAAAACGGTTGGAAAAATTATACGGTAAAGAGCGAATTTTTCGCGCTTTAGCAATTGATCAGCGCGGCGCGTTAAAGCGGATGCTGGGTGAAGAGGTAACGGATGAGCAGCTTCAGATTTTTAAAAGGTTAGTGTCCGAGAACTTGACGACACGGGCTTCAGCCATTTTGTTGGATCTGGAATTTGGCTGGCAGGCAGCGGGATTAAAAGAGCAGCATTGCGGTTTAATTATGGCTTACGAAAAAACCGGCTATGACAAAACCAAAATCGGACGTTTTCCCGATTTGATTGACGGCGTATCGGTTAAGGGGTTGAAAGAGAAAGGCGCAGATGCGGTGAAATTGCTGTTGTACTTTGATGTAGATGAGGGTGACGCGATTAATCGGGTGAAAACCGCTTTTGTAGAACGCGTCGGTTCCGAAT > 1/1393531‑1394020 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |