| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,393,272 | C→T | intergenic (+1284/+100) | unknown → / ← unknown | LSU ribosomal protein L20p/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,393,272 | 0 | C | T | 100.0% | 67.4 / NA | 25 | intergenic (+1284/+100) | unknown/unknown | LSU ribosomal protein L20p/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (11/14); total (11/14) | |||||||||||
AAAAACCGCTACCCAATTCTGGATAGCGGGGAGGTCTTAAATATAAGAAAACTTTAAAGACAACTGCATTTGCAGTGCACTAGCAATTATTAAGACTAGAAACAGAAAAAATAGTTCGTAAAAATG‑AAAAAAAACTTGTAATTTACAAAAGCTTACATTCTATTTTTTCGAAGACCTGTAACTCATTAATAAATAGTAAGAAAACTTTTTAAATAAGATTAAATAACTTGTTTTGTAAATTCTTGTATGAGGTTTTTTTGTTCTTAACCATCTCTTTTCAGCTATTGTCGGTTGTAACCGACAGATTTCTATGGTGCCTGTCCTAGCCTACCACTTCTACTTTAAAAAATACTAAAATTTTTGACCGCACTTTTTTCTCTCTCGAATCCCGGCAAAGCATCGCCTATTAATTTTAGAAAATACGATTTGTAATGTTTTGTGATATTGATCACAACTTTCATAAGTT > 1/1393031‑1393496 | aaaaaCCGCTACCCAATTCTGGATAGCGGGGAGGTCTTAAATATAAGAAAACTTTAAAGACAACTGCATTTGCAGTGCACTAGCAATTATTAAGACTAGAAACAGAAAAAATAGTTCGTAAAAATGAAAAAAAAACTTGTAATTTACAAAAGCTTACATTCTATTTTTTCGAAGACCTGTAACTCATTAATAAATAGTAAGAAAACTTTTTAAATAAGATTAAATAACTTGTTTTGTAAATTTTTGTATGa > 1:464355/1‑251 (MQ=255) 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aaaTAACTTGTTTTGTAAATTTTTGTATGAGGTTTTTTTGTTCTTAACCATCTCTTTTCAGCTATTGTCGGTTGTAACCGACAGATTTCTATGGTGCCTGTCCTAGCCTACCACTTCTACTTTAAAAAATACTAAAAtttt < 1:723992/141‑1 (MQ=255) aaTAACTTGTTTTGTAAATTTTTGTATGAGGTTTTTTTGTTCTTAACCATCTCTTTTCAGCTATTGTCGGTTGTAACCGACAGATTTCTATGGTGCCTGTCCTAGCCTACCACTTCTACTTTAAAAAATACTAAAATTTTTGACCGCACTTTTTTCTCTCTCGAATCCCGGCAAAGCATCGCCTATTAATTTTAGAAAATACGATTTGTAAt < 1:580674/212‑1 (MQ=255) gTTTTGTAAATTTTTGTATGAGGTTTTTTTGTTCTTAACCATCTCTTTTCAGCTATTGTCGGTTGTAACCGACAGATTTCTATgg < 1:139262/85‑1 (MQ=255) | AAAAACCGCTACCCAATTCTGGATAGCGGGGAGGTCTTAAATATAAGAAAACTTTAAAGACAACTGCATTTGCAGTGCACTAGCAATTATTAAGACTAGAAACAGAAAAAATAGTTCGTAAAAATG‑AAAAAAAACTTGTAATTTACAAAAGCTTACATTCTATTTTTTCGAAGACCTGTAACTCATTAATAAATAGTAAGAAAACTTTTTAAATAAGATTAAATAACTTGTTTTGTAAATTCTTGTATGAGGTTTTTTTGTTCTTAACCATCTCTTTTCAGCTATTGTCGGTTGTAACCGACAGATTTCTATGGTGCCTGTCCTAGCCTACCACTTCTACTTTAAAAAATACTAAAATTTTTGACCGCACTTTTTTCTCTCTCGAATCCCGGCAAAGCATCGCCTATTAATTTTAGAAAATACGATTTGTAATGTTTTGTGATATTGATCACAACTTTCATAAGTT > 1/1393031‑1393496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |