| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,384,097 | A→C | L284F (TTA→TTC) | unknown → | Possible protease sohB (EC 3.4.21.‑) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,384,097 | 0 | A | C | 100.0% | 185.2 / NA | 65 | L284F (TTA→TTC) | unknown | Possible protease sohB (EC 3.4.21.‑) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (36/29); total (36/29) | |||||||||||
TCGGTGTGGTAGCGCAGATTCCAAATGTTCATCGCCTACTAAAAAAACATGATGTGGATGTGGACGTGATGACGGCAGGCGAATATAAACGCACTATGACGATTTTTGGTGAAAATACCGAAAAAGGAAAGCAAAAATTCCAACAGGAATTAGAAGAAACTCATCAGTTATTCAAGCAATTTGTCGCACAGAATCGACCGCACTTGGATCTGGATAAAGTAGCAACAGGGGAACATTGGTTAGGTCAGCAGGCATTAAATTTAAATTTAGTGGATGAGATTATGACCAGCGATGATTTGCTATTACAGGCGATGAAAGAGAAATCGGTTATCGGCGTAAAATATGCGGTGAAGAAATCGTTATTACAAAAAGTCGGTAAACAGGCGGAAGAAAGTGCCGATAATATTGCTTTACGTTGGCTTAAGAAAAATGAAAGAACATTGATATAACATCCTATTTTTTTCGATTCTATTTATAC > 1/1383856‑1384333 | tCGGTGTGGTAGCGCAGATTCCAAATGTTCATCGCCTACTAAAAAAACATGATGTGGATGTGGACGTGATGACGGCAGGCGAATATAAACGCACTATGACGATTTTTGGTGAAAATACCGAAAAAGGAAAGCAAAAATTCCAACAGGAATTAGAAGAAACTCATCAGTTATTCAAGCAATTTGTCGCACAGAATCGACCGCACTTGGATCTGGATAAAGTAGCAACAGGGGAACATTGGTTCGGTcagcag < 1:552117/251‑1 (MQ=255) 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gggAACATTGGTTCGGTCAGCAGGCATTAAATTTAAATTTAGTGGATGAGATTATGACCAGCGATGATTTGCTATTACAGGCGATGAAAGAGAAATCGGTTATCGGCGTAAAATATGCGGTGAAGAAATCGTTATTACAAAAAGTCGGTAAACAGGCGGAAGAAAGTGCCGATAATATTGCTTTACGTTGGCTTAAGAAAAATGAAAGAACATTGATATAACATCCTATTTTTTTCGATTCTATTTATAc < 1:550210/250‑1 (MQ=255) ggAACATTGGTTCGGTCAGCAGGCATTAAATTTAAATTTAGTGGATGAGATTATGACCAGCGATGATTTGCTATTACAGGCGATGAAAGAGAAATCGGTTATCGGCGTAAAATATGCGGTGAAGAAATCGTTATTACAAAAAGTCGGTAAACAGGCGGAAGAAAGTGCCGATAATATTGCTTTACGTTGGCTTAAGAAAAATGAAAGAACATTGATATAACa > 1:785516/1‑222 (MQ=255) gAACATTGGTTCGGTCAGCAGGCATTAAATTTAAATTTAGTGGATGAGATTATGACCAGCGATGATTTGCTATTACAGGCGATGAAAGAGAAATCGGTTATCGGCGTAAAATATGCGGTGAAGAAATCGTTATTACAAAAAGTCGGTAAACAGGCGGAAGAAAGTGCCGATAATATTGCTTTACGTTGGCTTAAGAAAAATGAAAGAACATTGATATAAc > 1:212256/1‑220 (MQ=255) | TCGGTGTGGTAGCGCAGATTCCAAATGTTCATCGCCTACTAAAAAAACATGATGTGGATGTGGACGTGATGACGGCAGGCGAATATAAACGCACTATGACGATTTTTGGTGAAAATACCGAAAAAGGAAAGCAAAAATTCCAACAGGAATTAGAAGAAACTCATCAGTTATTCAAGCAATTTGTCGCACAGAATCGACCGCACTTGGATCTGGATAAAGTAGCAACAGGGGAACATTGGTTAGGTCAGCAGGCATTAAATTTAAATTTAGTGGATGAGATTATGACCAGCGATGATTTGCTATTACAGGCGATGAAAGAGAAATCGGTTATCGGCGTAAAATATGCGGTGAAGAAATCGTTATTACAAAAAGTCGGTAAACAGGCGGAAGAAAGTGCCGATAATATTGCTTTACGTTGGCTTAAGAAAAATGAAAGAACATTGATATAACATCCTATTTTTTTCGATTCTATTTATAC > 1/1383856‑1384333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |