| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,382,788 | G→A | P89L (CCG→CTG) | unknown ← | FMN‑dependent NADH‑azoreductase (EC 1.7.1.6) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,382,788 | 0 | G | A | 100.0% | 151.0 / NA | 53 | P89L (CCG→CTG) | unknown | FMN‑dependent NADH‑azoreductase (EC 1.7.1.6) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/30); total (23/30) | |||||||||||
AATGCCTTCTGCATACACGAATTGCACATCGGTAATACCCACGAAACCTAAAATCATTTTTAAGTATGCCGTGACGATATCGGAAGATTGATTTTGGTGGAACCCGCCGAATACAGCTAATACCACGGCTTTTTTGCCTGTTAATAATCCTTCAGGGCCTTCCTCCGTATATTGAAATGTTACGCGAGGGCGTGCAATGAAATCAAAATAGCTTTTTAATTGGGTAGGGATATTAAAATTATACATCGGTGCATTGATGATAATGGTGTTTGCGTTTTTAATTTCGGCGACTAATTCATCAGATAACGCCAATAATGCGTTTTCTTCCGCTGTCGTCGGTTGACCGCGTAGGGC‑GGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTGGATTTT > 1/1382541‑1383033 | aaTGCCTTCTGCATACACGAATTGCACATCGGTAATACTCACGAAACCTAAAATCATTTTTAAGTATGCCGTGACGATATCGGAAGATTGATTTTGGTGGAACCCGCCGAATACAGCTAATACCACGGCTTTTTTGCCTGTTAATAATCCTTCAGGGCCTTCCTCCGTATATTGAAATGTTACGCGAGGGCGTGCAATGAAATCAAAATAGCTTTTTAATTGGGTAGGGATATTAAAATTATACATCAGTg > 1:405508/1‑251 (MQ=255) 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ttATACATCAGTGCATTGATGATAATGGTGTTTGCGTTTTTAATTTCGGCGACTAATTCATCAGATAACGCCAATAATGCGTTTTCTTCCGCTGTCGTCGGTTGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTgg > 1:396432/1‑251 (MQ=255) ataCATCAGTGCATTGATGATAATGGTGTTTGCGTTTTTAATTTCGGCGACTAATTCATCAGATAACGCCAATAATGCGTTTTCTTCCGCTGTCGTCGGTTGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACAGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAg > 1:448730/1‑241 (MQ=255) cATCAGTGCATTGATGATAATGGTGTTTGCGTTTTTAATTTCGGCGACTAATTCATCAGATAACGCCAATAATGCGTTTTCTTCCGCTGTCGTCGGTTGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGAt < 1:270051/159‑1 (MQ=255) cATCAGTGCATTGATGATAATGGTGTTTGCGTTTTTAATTTCGGCGACTAATTCATCAGATAACGCCAATAATGCGTTTTCTTCCGCTGTCGTCGGTTGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGAt > 1:691875/1‑159 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |