| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,350,476 | T→C | G29G (GGT→GGC) | unknown → | Pyruvate dehydrogenase E1 component (EC 1.2.4.1) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,350,476 | 0 | T | C | 100.0% | 200.7 / NA | 69 | G29G (GGT→GGC) | unknown | Pyruvate dehydrogenase E1 component (EC 1.2.4.1) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (43/26); total (43/26) | |||||||||||
TCGTATTATTTGTTAAAAATTTGTAATGTCTGTTTTTTGTACAGAAATTGTATAAGAATTTTTGACAGATTAAACATATTTTAGTTATCAATTCGTTGTTTAATTTCTACAAAAGTAGGTTAAACGTACTTCTAACTTAACAAAGATAAGGAAAAAGCTATGTCAGAATTGTTAAAAAATGACGTAGATCCGATCGAAACTAACGATTGGTTGGCAGCAATTGATTCGTTAATTCGTGAAGAAGGTGTT‑‑GAGCGTGCGCAGTTCATTATTGATCAAGTGATGCAGCAAGCTCGTATTGGCGGCGTTTCTTTGCCGACAGGGATTACTACAGATTACGTGAATACGATCCCGGTTTCTGAACAGCCCGAGTATCCGGGAAATTTAGACATTGAGCGTCGTATTCGTTCTTATGTCCGCTGGAATGCTGTGATGATGGTGTTGCGCGGTCAGAAAAAAGACCTTGATTTAGGCGGTCACTTATCTACTTTC > 1/1350231‑1350719 | tCGTATTATTTGTTAAAAATTTGTAATGTCTGTTTTTTGTACAGAAATTGTATAAGAATTTTTGACAGATTAAACATATTTTAGTTATCAATTCGTTGTTTAATTTCTACAAAAGTAGGTTAAACGTACTTCTAACTTAACAAAGATAAGGAAAAAGCTATGTCAGAATTGTTAAAAAATGACGTAGATCCGATCGAAACTAACGATTGGTTGGCAGCAATTGATTCGTTAATTCGTGAAGAAGGCGTT‑‑Ga > 1:345282/1‑251 (MQ=255) 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1:607771/1‑155 (MQ=255) ttCGTGAAGAAGGCGTT‑‑GAGCGTGCGCAGTTCATTATTGATCAAGTGATGCAGCAAGCTCGTATTGGCGGCGTTTCTTTGCCGACAGGGATTACTACAGATTACGTGAATACGATCCCGGTTTCTGAACAGCCCGAGTATCCGGGAAATTTAGACATTGAGCGTCGTATTCGTTCTTATGTCCGCTGGAATGCTGTGATGATGGTGTTGCGCGGTCAGAAAAAAGACCTTGATTTAGGCGGTCACTTATCt < 1:363004/251‑1 (MQ=255) cGTGAAGAAGGCGTT‑‑GAGCGTGCGCAGTTCATTATTGATCAAGTGATGCAGCAAGCTCGTATTGGCGGCGTTTCTTTGCCGACAGGGATTACTACAGATTACGTGAATACGATCCCGGTTTCTGAACAGCCCGAGTATCCGGGAAATTTAGACATTGAGCGTCGTATTCGTTCTTATGTCCGCTGGAATGCTGTGATGATGGTGTTGCGCGGTCAGAAAAAAGACCTTGATTTAGGCGGTCACTTATCTAc < 1:341270/251‑1 (MQ=255) agaagGCGTT‑‑GAGCGTGCGCAGTTCATTATTGATCAAGTGATGCAGCAAGCTCGTATTGGCGGCGTTTCTTTGCCGACAGGGATTACTACAGATTACGTGAATACGATCCCGGTTTCTGAACAGCCCGAGTATCCGGGAAATTTAGACATTGAGCGTCGTATTCGTTCTTATGTCCGCTGGAATGCTGTGATGATGGTGTTGCGCGGTCAGAAAAAAGAc < 1:211394/220‑1 (MQ=255) agaagGCGTT‑‑GAGCGTGCGCAGTTCATTATTGATCAAGTGATGCAGCAAGCTCGTATTGGCGGCGTTTCTTTGCCGACAGGGATTACTACAGATTACGTGAATACGATCCCGGTTTCTGAACAGCCCGAGTATCCGGGAAATTTAGACATTGAGCGTCGTATTCGTTCTTATGTCCGCTGGAATGCTGTGATGATGGTGTTGCGCGGTCAGAAAAAAGACCTTGATTTAGGCGGTCACTTATCTACTTTc > 1:418839/1‑250 (MQ=255) | TCGTATTATTTGTTAAAAATTTGTAATGTCTGTTTTTTGTACAGAAATTGTATAAGAATTTTTGACAGATTAAACATATTTTAGTTATCAATTCGTTGTTTAATTTCTACAAAAGTAGGTTAAACGTACTTCTAACTTAACAAAGATAAGGAAAAAGCTATGTCAGAATTGTTAAAAAATGACGTAGATCCGATCGAAACTAACGATTGGTTGGCAGCAATTGATTCGTTAATTCGTGAAGAAGGTGTT‑‑GAGCGTGCGCAGTTCATTATTGATCAAGTGATGCAGCAAGCTCGTATTGGCGGCGTTTCTTTGCCGACAGGGATTACTACAGATTACGTGAATACGATCCCGGTTTCTGAACAGCCCGAGTATCCGGGAAATTTAGACATTGAGCGTCGTATTCGTTCTTATGTCCGCTGGAATGCTGTGATGATGGTGTTGCGCGGTCAGAAAAAAGACCTTGATTTAGGCGGTCACTTATCTACTTTC > 1/1350231‑1350719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |