| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,346,226 | A→G | intergenic (‑129/‑44) | unknown ← / → unknown | Maltodextrin phosphorylase (EC 2.4.1.1)/Transcriptional activator of maltose regulon, MalT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,346,226 | 0 | A | G | 100.0% | 187.9 / NA | 61 | intergenic (‑129/‑44) | unknown/unknown | Maltodextrin phosphorylase (EC 2.4.1.1)/Transcriptional activator of maltose regulon, MalT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (38/23); total (38/23) | |||||||||||
GCAATCACGCGATACCATTGGTCGAGGGCGAATTGTTTGGCTGATTGCACATCAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAAAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAATGGGTCGCCGGGCAGAAAAATGTCGGTTGGTATTCTTTAGATGAAA > 1/1345979‑1346468 | gCAATCACGCGATACCATTGGTCGAGGGCGAATTGTTTGGCTGATTGCACATCAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGagaaa > 1:637740/1‑251 (MQ=255) aCCATTGGTCGAGGGCGAATTGTTTGGCTGATTGCACATCAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCttt > 1:134250/1‑250 (MQ=255) gTCGAGGGCGAATTGTTTGGCTGATTGCACATCAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGt > 1:569204/1‑246 (MQ=255) tCGAGGGCGAATTGTTTGGCTGATTGCACATCAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGt < 1:179074/251‑1 (MQ=255) gggCGAATTGTTTGGCTGATTGCACATCAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCaa > 1:612655/1‑251 (MQ=255) cGAATTGTTTGGCTGATTGCACATCAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTc < 1:585964/251‑1 (MQ=255) ttGCACATCAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAAtc < 1:548991/209‑1 (MQ=255) cAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTc < 1:668799/222‑1 (MQ=255) cAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTc > 1:133031/1‑249 (MQ=255) aaaTAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCAt > 1:665023/1‑250 (MQ=255) aCAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATc < 1:40882/250‑1 (MQ=255) ttGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTc < 1:444238/250‑1 (MQ=255) gTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTc < 1:631344/225‑1 (MQ=255) gTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCaa > 1:853980/1‑250 (MQ=255) gTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCaa > 1:550359/1‑250 (MQ=255) gTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCaa > 1:563443/1‑250 (MQ=255) ttCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCg < 1:339506/250‑1 (MQ=255) gttTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTc < 1:176333/211‑1 (MQ=255) gttTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAAc > 1:151677/1‑250 (MQ=255) gttTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAAc > 1:48888/1‑250 (MQ=255) ggCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAAtt > 1:532337/1‑201 (MQ=255) gCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAAtt < 1:576289/163‑1 (MQ=255) gCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTc > 1:459805/1‑205 (MQ=255) gCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTg > 1:270790/1‑251 (MQ=255) tAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTg > 1:556554/1‑248 (MQ=255) aaGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGAc < 1:231347/251‑1 (MQ=255) aGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACa > 1:155742/1‑251 (MQ=255) atttatttCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAAc > 1:577575/1‑195 (MQ=255) tCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAAc > 1:54087/1‑188 (MQ=255) tGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGAt < 1:490902/250‑1 (MQ=255) gTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATg > 1:22547/1‑141 (MQ=255) gTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCa > 1:489989/1‑251 (MQ=255) gTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTACAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTg > 1:642131/1‑164 (MQ=255) ttattaTGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGt > 1:787297/1‑139 (MQ=255) tGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCg < 1:317229/103‑1 (MQ=255) gTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCa > 1:691949/1‑251 (MQ=255) gTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATc < 1:767510/131‑1 (MQ=255) gTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATcc > 1:645597/1‑215 (MQ=255) tAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCaa < 1:701273/250‑1 (MQ=255) cGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCt < 1:870198/238‑1 (MQ=255) aaaTCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAaccac > 1:637146/1‑249 (MQ=255) tcctccCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCtt < 1:227244/199‑1 (MQ=255) ctccCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAAtt > 1:714208/1‑128 (MQ=255) gCTATAATCTTGCCGGTATGACTACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTc < 1:237777/81‑1 (MQ=255) gCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGtt < 1:698372/74‑1 (MQ=255) gCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGt > 1:36658/1‑102 (MQ=255) gCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGttt > 1:565953/1‑163 (MQ=255) gCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGAtt > 1:308401/1‑209 (MQ=255) gCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCaa > 1:876513/1‑251 (MQ=255) gCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCaa > 1:476405/1‑251 (MQ=255) cTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAAt > 1:325367/1‑251 (MQ=255) gTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAATGGGTCGCCGGGCAg > 1:62704/1‑251 (MQ=255) acaacaAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAATGGGTCGCCGGGCAGaaaaa > 1:68131/1‑251 (MQ=255) caacaaGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGgcg > 1:551299/1‑164 (MQ=255) acaaGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAATGGGTCGCCGGGCAGAAAAATGt < 1:21968/251‑1 (MQ=255) gAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAAc > 1:225254/1‑125 (MQ=255) aaTTCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAATGGGTCGCCGGGCAGAAAAATGTCGGTTGGTAt < 1:768778/251‑1 (MQ=255) tCGTTAGACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAATGGGTCGCCGGGCAGAAAAATGTCGGTTGGTAtt > 1:153896/1‑249 (MQ=255) gACTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGAt < 1:45531/166‑1 (MQ=255) aCTAGGTAGGAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAATGGGTCGCCGGGCAGAAAAATGTCGGTTGGTATTCTTTAGATg < 1:102558/251‑1 (MQ=255) aggtaggAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTAt > 1:657315/1‑102 (MQ=255) aggtaggAGAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAATGGGTCGCCGGGCAGAAAAATGTCGGTTGGTATTCTTTAGATGaaa > 1:457117/1‑251 (MQ=255) | GCAATCACGCGATACCATTGGTCGAGGGCGAATTGTTTGGCTGATTGCACATCAAAATAACGGCAATATTTTTTGACAATCGCATCAAATGCGTTGTCATAGGTTCGTTGTTTAGGCATAAAAGGGGCTCCTGATTAATCAATTTATTTCGTGGTTTTATTATGTTTAATCAAAGTAAAACGAAATCCTCCCTGCTATAATCTTGCCGGTATGACAACAAGGAAGTAATTCGTTAGACTAGGTAGGAAAAATCCTCCTTCTTTCGTTATAGTTCAATTCACGATTAAAATTATGTTAATTCCATCAAAGTTAATTTGTTCTTATCGCCTGCAAAACAGTATTCAACGGGATCGTTTAACCCGCTTGCTGGACAAGGCGCATCTTTATCCGCTGGTGCTGATTCATGCGCCGGCAGGCTATGGCAAAACCACCTTAATTTCCCAATGGGTCGCCGGGCAGAAAAATGTCGGTTGGTATTCTTTAGATGAAA > 1/1345979‑1346468 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |